More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2577 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2577  thioredoxin  100 
 
 		 162 aa  332  9e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09641  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2283  thioredoxin  54.17 
 
 		 173 aa  187  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000888091  normal  0.229948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  56.46 
 
 		 500 aa  169  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0633  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  41.29 
 
 		 205 aa  159  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0261257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3617  thioredoxin  52.35 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1716  hypothetical protein  40.35 
 
 		 193 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0680604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2353  thioredoxin  39.87 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000260475  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  36.36 
 
 		 120 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  35.54 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  40.85 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  32.23 
 
 		 108 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  37.11 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  43.48 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  30.77 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  37 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  38.2 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  36.67 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  40.58 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  39.53 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  42.19 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  39.53 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  40.58 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  35.96 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  43.53 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  40.58 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  36.08 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1420  thioredoxin  34.88 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.669095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  39.13 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  39.13 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  39.13 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  39.13 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  39.13 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  39.13 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  39.13 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  39.13 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  39.13 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  39.13 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  39.13 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  39.13 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  38.2 
 
 		 312 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  39.13 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  39.13 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  39.13 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  49.21 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  49.12 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  39.44 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  38.04 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  30 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  47.27 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  33.02 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  30 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  38.03 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  42.03 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  40.58 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  38.16 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  39.13 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  30 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  45.45 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  40.28 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  37.97 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  37.68 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  42.03 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  46.43 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  37.5 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  32.04 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  47.27 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  40.28 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  36.36 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  34.62 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  40.28 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  40.54 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  34.62 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  39.13 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  32.95 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  34.72 
 
 		 310 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  40 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  36.05 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  36.26 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  33.96 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  31 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  31.07 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  34.38 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  37.21 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  40.26 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  35.48 
 
 		 337 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  37.21 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  40.62 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  37.36 
 
 		 108 aa  62  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  41.33 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  43.75 
 
 		 306 aa  62  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  36.47 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  33.64 
 
 		 108 aa  62  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  37.68 
 
 		 287 aa  62  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  47.27 
 
 		 107 aa  62  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  32.22 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  36.05 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  42.65 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>