46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2413 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  346  9e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  62.96 
 
 		 182 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  36.31 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  38.76 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  39.87 
 
 		 177 aa  102  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1156  hypothetical protein  34.44 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  27.8 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  30.86 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  27.27 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  31.18 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  26.77 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  26.96 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  26.96 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  26.4 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  29.82 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  29.44 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  31.21 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  27.98 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  31.76 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  27.46 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  31.07 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  28.66 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  31.64 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  30 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  27.18 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  27.55 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  29.38 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  30.41 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  27.93 
 
 		 215 aa  51.2  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  29.59 
 
 		 183 aa  51.2  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  29.65 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  26.09 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  29.71 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  31.95 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  29.44 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  25.68 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  30.99 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  28.65 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  30.3 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  30.99 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  25.14 
 
 		 186 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2336  hypothetical protein  28.87 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  28.49 
 
 		 283 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  27.41 
 
 		 203 aa  42  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  32.53 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>