47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0654 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  86.72 
 
 		 249 aa  428  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  36.71 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  38.07 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  31.98 
 
 		 237 aa  131  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  29.87 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  26.13 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  24.89 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  29.71 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  26.03 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  23.61 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  26.09 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  30 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  27.52 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  24.06 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  26.39 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  25.38 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.98 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  23.31 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  25.93 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  23.33 
 
 		 167 aa  53.9  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  18.75 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  21.48 
 
 		 485 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1733  hypothetical protein  23.68 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0103078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  32.88 
 
 		 99 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 85 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 90 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  32.88 
 
 		 90 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  32.88 
 
 		 90 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 110 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  32.88 
 
 		 90 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 90 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  20 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 96 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5380  transcriptional regulator, ArsR family  26.67 
 
 		 117 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  29.73 
 
 		 119 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 109 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 		 119 aa  42.7  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  29.73 
 
 		 119 aa  42.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3425  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 115 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.461956  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  24.09 
 
 		 385 aa  42.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 		 115 aa  42  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 87 aa  41.6  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>