119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1044 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1044  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  100 
 
 
182 aa  366  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  71.26 
 
 
171 aa  230  9e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  68.24 
 
 
174 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0628  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  68.82 
 
 
174 aa  224  6e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  67.65 
 
 
174 aa  223  9e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  45.91 
 
 
166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  46.2 
 
 
158 aa  135  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  45.96 
 
 
159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0074  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  45.28 
 
 
166 aa  124  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  42.68 
 
 
186 aa  115  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  41.67 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  36.59 
 
 
183 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  45 
 
 
160 aa  105  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0582  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  45.18 
 
 
159 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.724194  normal  0.0407733 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1336  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  43.98 
 
 
160 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.291091  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0256  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  43.37 
 
 
160 aa  99.4  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  34.76 
 
 
160 aa  91.7  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  29.94 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  35.67 
 
 
181 aa  82  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  31.85 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  29.11 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  33.6 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  30.57 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  29.94 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  32.28 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  31.41 
 
 
222 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  32 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  32 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  32 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  29.11 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  24.52 
 
 
167 aa  61.6  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  31.01 
 
 
203 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  30.16 
 
 
195 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  30.16 
 
 
195 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  30.16 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  30.16 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  30.16 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  30.16 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  30.16 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  36.78 
 
 
214 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  30.82 
 
 
208 aa  58.9  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  30.16 
 
 
195 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  30.23 
 
 
209 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  28.46 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  30.16 
 
 
195 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  33.33 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  29.37 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  29.37 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  29.37 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  29.37 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  29.46 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  25.32 
 
 
167 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  30.32 
 
 
172 aa  55.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  26.14 
 
 
167 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  30.77 
 
 
218 aa  55.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  26.83 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  29.37 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  32.54 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  23.93 
 
 
157 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  30.38 
 
 
159 aa  52  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  25.9 
 
 
206 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  36.67 
 
 
208 aa  52  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  35.51 
 
 
156 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  26.63 
 
 
206 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1164  HyaD peptidase  36.59 
 
 
198 aa  51.2  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  32.56 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  31.29 
 
 
165 aa  50.8  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  28.3 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  29.68 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25.16 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  29.34 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  24.54 
 
 
166 aa  49.3  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  28.48 
 
 
160 aa  48.5  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  28.04 
 
 
157 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  30.38 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  29.2 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  27.85 
 
 
160 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  27.81 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  27.85 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  27.39 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  25.95 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  24.86 
 
 
181 aa  46.2  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  35.29 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  27.27 
 
 
179 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  31 
 
 
161 aa  45.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  30 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.11 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  27.18 
 
 
157 aa  45.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  27.18 
 
 
157 aa  45.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  26.17 
 
 
161 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  30.13 
 
 
176 aa  44.7  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4597  hydrogenase maturation protease  27.27 
 
 
187 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  26.17 
 
 
161 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  28.89 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  25.79 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1488  hydrogenase maturation protease HycI  27.82 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  30.91 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  28.85 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  27.92 
 
 
194 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  27.78 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>