More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0684 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0684  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 
334 aa  655    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  77.84 
 
 
334 aa  531  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  77.54 
 
 
334 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  77.84 
 
 
334 aa  528  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1286  hydrogenase expression/formation protein HypE  76.95 
 
 
334 aa  497  1e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.48 
 
 
331 aa  347  2e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.18 
 
 
331 aa  331  9e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  50 
 
 
347 aa  330  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 
331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.6 
 
 
339 aa  319  5e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0364  hypothetical protein  50.15 
 
 
341 aa  310  2e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1413  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.99 
 
 
331 aa  294  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0720065  normal  0.131563 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.79 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.2 
 
 
347 aa  282  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.81 
 
 
341 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.05 
 
 
348 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0506  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.81 
 
 
341 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.777692  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.05 
 
 
335 aa  279  4e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0501  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.22 
 
 
341 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.71 
 
 
337 aa  279  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  44.44 
 
 
335 aa  279  6e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.74 
 
 
345 aa  278  7e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.6 
 
 
345 aa  275  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2333  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.01 
 
 
365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.76 
 
 
349 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.49 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.2 
 
 
367 aa  272  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.81 
 
 
330 aa  272  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.18 
 
 
344 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0933  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.59 
 
 
352 aa  271  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.900318  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.58 
 
 
333 aa  271  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.31 
 
 
352 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.9 
 
 
352 aa  269  4e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.54 
 
 
336 aa  269  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.7 
 
 
366 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0515  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.71 
 
 
340 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0993017 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.83 
 
 
350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.04 
 
 
345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.04 
 
 
347 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  41.07 
 
 
346 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.54 
 
 
336 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.34 
 
 
350 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.72 
 
 
351 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.65 
 
 
354 aa  263  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.43 
 
 
334 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.86 
 
 
368 aa  262  6.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.76 
 
 
349 aa  261  8e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.11 
 
 
367 aa  261  8.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.18 
 
 
351 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.84 
 
 
336 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.83 
 
 
352 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  40 
 
 
348 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.18 
 
 
348 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  43.19 
 
 
351 aa  259  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.44 
 
 
349 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.76 
 
 
341 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.27 
 
 
335 aa  257  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.35 
 
 
352 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.44 
 
 
336 aa  255  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.71 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.46 
 
 
338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.25 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.05 
 
 
340 aa  251  1e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.14 
 
 
330 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.6 
 
 
325 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.44 
 
 
359 aa  251  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.12 
 
 
348 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.32 
 
 
337 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.84 
 
 
349 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.35 
 
 
348 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.67 
 
 
355 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.67 
 
 
355 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.67 
 
 
355 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.24 
 
 
336 aa  248  8e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.32 
 
 
337 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.94 
 
 
354 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.18 
 
 
359 aa  246  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.74 
 
 
336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.46 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.88 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.96 
 
 
370 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.02 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.09 
 
 
348 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.09 
 
 
348 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.82 
 
 
328 aa  241  9e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.76 
 
 
341 aa  241  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.16 
 
 
338 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  42 
 
 
373 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.72 
 
 
338 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.12 
 
 
355 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3234  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.57 
 
 
372 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.42 
 
 
330 aa  241  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.823142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.94 
 
 
342 aa  239  5e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4587  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.4 
 
 
437 aa  239  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  40.42 
 
 
356 aa  238  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.65 
 
 
336 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.54 
 
 
348 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.42 
 
 
354 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.06 
 
 
336 aa  236  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.06 
 
 
336 aa  236  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>