41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0492 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 
319 aa  658    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  69.13 
 
 
313 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  69.13 
 
 
313 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  67.52 
 
 
313 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  66.24 
 
 
313 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  41.16 
 
 
345 aa  249  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  41.04 
 
 
308 aa  242  5e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  43.09 
 
 
316 aa  241  9e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  40 
 
 
361 aa  237  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  38.76 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  39.71 
 
 
350 aa  226  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  36.25 
 
 
299 aa  222  6e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  36.25 
 
 
325 aa  222  7e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  38.52 
 
 
345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  35.76 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  36.89 
 
 
364 aa  211  9e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  36.94 
 
 
341 aa  202  4e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  34.01 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  34.22 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  36.05 
 
 
311 aa  183  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  33.85 
 
 
351 aa  181  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  35.38 
 
 
358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  31.42 
 
 
297 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  34.57 
 
 
380 aa  177  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  35.09 
 
 
358 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  33.44 
 
 
351 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  31.73 
 
 
358 aa  171  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  33.88 
 
 
416 aa  163  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  33.9 
 
 
515 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  36.33 
 
 
708 aa  157  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  33.79 
 
 
786 aa  155  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 
501 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 
367 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  22.52 
 
 
354 aa  46.2  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 
608 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  21.74 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35520  Molybdenum cofactor biosynthesis protein  24.28 
 
 
287 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785405  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 
251 aa  43.5  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 
329 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 
329 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 
287 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>