291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0368 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0368  co-chaperone GrpE  100 
 
 
206 aa  410  1e-114  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.722414  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl416  hsp70 cofactor  52.67 
 
 
187 aa  162  3e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  30 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  30 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  31.54 
 
 
197 aa  82  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  30 
 
 
186 aa  82  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  31.54 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.11 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  30.6 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  28.83 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf619  heat shock protein GrpE  35.83 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  29.46 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  30.13 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  28.46 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  31.34 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  31.25 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  33.77 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  30.47 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  28.12 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  30.6 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  27.13 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  28.68 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  27.27 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  28.03 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  30.83 
 
 
228 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  29.1 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  29.69 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  29.69 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  27.82 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0936  heat shock protein GrpE  32.03 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0941203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  26.14 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  27.27 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1196  GrpE protein  26.32 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  30.86 
 
 
192 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  30.23 
 
 
240 aa  62.8  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  30.53 
 
 
181 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  28.68 
 
 
198 aa  63.2  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  28.03 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  32.03 
 
 
181 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  31.78 
 
 
190 aa  62.4  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  28.24 
 
 
197 aa  62  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  27.95 
 
 
171 aa  61.6  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  27.95 
 
 
171 aa  61.6  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  28.68 
 
 
193 aa  61.6  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  25.48 
 
 
191 aa  61.6  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  30.47 
 
 
181 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  27.91 
 
 
173 aa  61.6  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  28.1 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  27.27 
 
 
198 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  25.98 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  30.47 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  30.57 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  29.92 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  26.8 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  30.47 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  30.47 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  29.92 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  29.13 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  27.91 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  30.47 
 
 
194 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  29.27 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  29.1 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  27.66 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  28.37 
 
 
210 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  25.78 
 
 
181 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  26.36 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  31.25 
 
 
184 aa  58.5  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  25.93 
 
 
217 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  27.89 
 
 
203 aa  58.5  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  27.27 
 
 
188 aa  58.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  28.37 
 
 
204 aa  58.2  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  25.19 
 
 
226 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0564  GrpE protein  28.78 
 
 
211 aa  58.2  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  28.91 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  28.35 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  29.76 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  25 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  23.53 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  28.31 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  26.97 
 
 
206 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  25.66 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  28.15 
 
 
245 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  28.35 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  26.52 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  26.52 
 
 
188 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  28.91 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0450  co-chaperone GrpE  30 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  26.14 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  28.1 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  28.12 
 
 
176 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>