291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2742 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  100 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  39.23 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  39.11 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  35.23 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  35.8 
 
 		 220 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  36.42 
 
 		 196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  36.71 
 
 		 220 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  38.15 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  38.15 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  35.22 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  38.15 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  38.15 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  36.08 
 
 		 214 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  38.27 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  36.48 
 
 		 192 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  36.48 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.48 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  36.48 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  36.48 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  36.48 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  36.48 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  35.44 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  34.81 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  36.48 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  36.48 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  36.25 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  31.22 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  36.16 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  35.08 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  36.08 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  34.71 
 
 		 206 aa  100  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  31.55 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  33.94 
 
 		 189 aa  97.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  34.55 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  35.26 
 
 		 187 aa  95.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  27.13 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  36.29 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  30.49 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  36.29 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  27.75 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  28.99 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2694  inner membrane protein YohD  35.66 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.88 
 
 		 668 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  24.84 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  27.56 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  25.86 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  25.86 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  27.74 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  27.27 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  28.66 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.68 
 
 		 671 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  31.62 
 
 		 641 aa  65.5  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.91 
 
 		 664 aa  65.1  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  30.15 
 
 		 681 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  24.65 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  29.6 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  34.53 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  29.85 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  30.08 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  27.22 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  28.95 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  27.68 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  27.68 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  27.68 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  27.68 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  27.18 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  27.68 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  27.05 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  29.14 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  26.92 
 
 		 351 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  31.16 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  29.1 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  26.15 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  27.43 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.08 
 
 		 521 aa  57.8  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  27.12 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  27.12 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  23.56 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  26.63 
 
 		 686 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  28.57 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.16 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.5 
 
 		 664 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.69 
 
 		 676 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.15 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  30.57 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  27.03 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  28.77 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  29.73 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  32.54 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  29.8 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329585 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  29.05 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  25.16 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  26.55 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>