More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2402 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 449 aa  895    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  39.59 
 
 		 410 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  46.22 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  41 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  44.8 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  37 
 
 		 376 aa  233  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  38.1 
 
 		 378 aa  229  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  37.69 
 
 		 390 aa  227  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  38.27 
 
 		 379 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  38.15 
 
 		 397 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  38.15 
 
 		 465 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  38.65 
 
 		 376 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  37.91 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  37.91 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  39.01 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  39.01 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  37.94 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  37.97 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  37.97 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  37.91 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  37.89 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  39.17 
 
 		 368 aa  213  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  39.88 
 
 		 346 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  37.43 
 
 		 391 aa  212  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  37 
 
 		 399 aa  212  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  38.32 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  35.83 
 
 		 388 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  36.9 
 
 		 391 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  34.43 
 
 		 389 aa  201  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 		 389 aa  199  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  38.44 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 391 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 391 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  35.97 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  35.95 
 
 		 382 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  35.95 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  34.5 
 
 		 384 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  35.39 
 
 		 361 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  34.81 
 
 		 384 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  33.51 
 
 		 385 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 		 384 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  31.34 
 
 		 383 aa  186  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  34.58 
 
 		 379 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  35.45 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  37.7 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  35.09 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  33.96 
 
 		 385 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  32.44 
 
 		 377 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  33.33 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  32.63 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  32.63 
 
 		 379 aa  173  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  32.78 
 
 		 344 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  33.42 
 
 		 373 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  32.9 
 
 		 379 aa  166  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  33.24 
 
 		 404 aa  161  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  34.56 
 
 		 374 aa  150  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  38.22 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  32.04 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  29.91 
 
 		 391 aa  140  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  41.31 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  40.98 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4734  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 		 420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  38.77 
 
 		 284 aa  126  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  37.96 
 
 		 240 aa  123  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  36.19 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  38.5 
 
 		 285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  37.1 
 
 		 238 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  30.79 
 
 		 366 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  37.18 
 
 		 199 aa  113  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  37.96 
 
 		 164 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  36.36 
 
 		 194 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  37.96 
 
 		 180 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  35.03 
 
 		 231 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  32.93 
 
 		 199 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2860  HPP  34.53 
 
 		 231 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  40.77 
 
 		 185 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  35.9 
 
 		 189 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  36.49 
 
 		 231 aa  97.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  39.86 
 
 		 183 aa  97.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  30 
 
 		 404 aa  97.1  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  35.23 
 
 		 180 aa  95.1  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  38.22 
 
 		 178 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1922  CBS domain containing membrane protein  29.35 
 
 		 196 aa  87.8  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  41.91 
 
 		 178 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  39.18 
 
 		 176 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  37.42 
 
 		 167 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  30.46 
 
 		 184 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  34.91 
 
 		 174 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  40.32 
 
 		 186 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  40.25 
 
 		 175 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  42.06 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  36.96 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  34.59 
 
 		 207 aa  79.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  43.56 
 
 		 173 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  40.58 
 
 		 178 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  41.28 
 
 		 207 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  32.84 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  42.86 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>