More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0618 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
366 aa  743    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  50.42 
 
 
359 aa  346  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  44.72 
 
 
360 aa  317  1e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  48.73 
 
 
361 aa  317  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  47.73 
 
 
355 aa  312  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  53.35 
 
 
361 aa  311  7.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  48.14 
 
 
356 aa  310  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  48.76 
 
 
372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  48.72 
 
 
352 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  43.58 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  39.83 
 
 
357 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  47.08 
 
 
359 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 
368 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  36.81 
 
 
364 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  37.6 
 
 
367 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  33.24 
 
 
331 aa  190  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 
371 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  31.66 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
354 aa  145  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  28.94 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  30.81 
 
 
384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  27.3 
 
 
361 aa  136  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
828 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3909  hypothetical protein  31.29 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  34.13 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5354  hypothetical protein  28.78 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  28.26 
 
 
1121 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
1476 aa  69.7  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  27.21 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.05 
 
 
2401 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 
740 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 
740 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  22.59 
 
 
365 aa  67  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1972  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
361 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3298  hypothetical protein  31.55 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0661206  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
360 aa  63.5  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
428 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  27.27 
 
 
1147 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5347  hypothetical protein  30.95 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.48 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  26.15 
 
 
1444 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  28.77 
 
 
1608 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.97 
 
 
388 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
924 aa  60.1  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
1271 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
1265 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
373 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 
1303 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  42.42 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.5 
 
 
396 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
402 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
535 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
345 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
390 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
379 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
345 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
414 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
418 aa  56.2  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
360 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1118  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
392 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.357165  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
821 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 
953 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
392 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  35.24 
 
 
418 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
1301 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
409 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0451  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
406 aa  54.7  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.340856  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  30.95 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1821  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
403 aa  53.9  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0709671  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
372 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
424 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
372 aa  53.9  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 
360 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
550 aa  53.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
369 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0077  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 
373 aa  53.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1658  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
372 aa  53.1  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00025615  hitchhiker  0.00378247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5335  hypothetical protein  28.28 
 
 
341 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
371 aa  53.1  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
361 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
434 aa  53.1  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
382 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
382 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
387 aa  52.8  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
382 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  24.76 
 
 
382 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
406 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
421 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  42.03 
 
 
374 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2628  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00259804  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
376 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>