65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0146 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  783    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  37.61 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  37.43 
 
 		 355 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  36.69 
 
 		 356 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  36.69 
 
 		 356 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  26.8 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  25.89 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  24.91 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  24.91 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  24.91 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  24.91 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  22.99 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  25.86 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  21.53 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  24.12 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4257  hypothetical protein  25.52 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4983  hypothetical protein  24.91 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.301738 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  24.24 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2975  hypothetical protein  25.34 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  23.73 
 
 		 383 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  24.71 
 
 		 441 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  24.6 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  22.91 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  29.9 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  21.25 
 
 		 346 aa  53.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1504  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.7 
 
 		 1049 aa  52.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000277903  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4379  protein of unknown function DUF201  24.34 
 
 		 323 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  21.84 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  25.23 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  25.98 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3365  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  26.37 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131382  normal  0.291758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  21.02 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.12 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  29.13 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  24.39 
 
 		 428 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  21.77 
 
 		 399 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  31.65 
 
 		 320 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  23.9 
 
 		 430 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.43 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  32.2 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  20.72 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  24.88 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  21.01 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  25.42 
 
 		 753 aa  46.6  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  21.98 
 
 		 412 aa  46.6  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  28.5 
 
 		 322 aa  46.6  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  27.27 
 
 		 414 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0661  hypothetical protein  20.8 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.015179  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  22.37 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2446  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.41 
 
 		 1106 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  26.97 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1692  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.36 
 
 		 1089 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  24 
 
 		 332 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  22.4 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  23.11 
 
 		 415 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.66 
 
 		 1079 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  25.63 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  23.78 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0767  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.35 
 
 		 1073 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.256868  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  23.79 
 
 		 457 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  27.31 
 
 		 400 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1670  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.74 
 
 		 1078 aa  43.1  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809225 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  24.9 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  21.83 
 
 		 513 aa  42.7  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  22.64 
 
 		 424 aa  42.7  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>