More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf612 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf612  DNA polymerase III subunit alpha  100 
 
 		 999 aa  2030    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.415572  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  38.51 
 
 		 1065 aa  550  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  34.82 
 
 		 1139 aa  531  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1759  DNA polymerase III, alpha subunit  37.3 
 
 		 1065 aa  527  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.463991  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1793  DNA polymerase III, alpha subunit  37.3 
 
 		 1065 aa  527  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  34.36 
 
 		 1181 aa  519  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  34.39 
 
 		 1139 aa  513  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  33.45 
 
 		 1092 aa  512  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  33.98 
 
 		 1109 aa  511  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  34.1 
 
 		 1132 aa  503  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  33.22 
 
 		 1075 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  33.63 
 
 		 1185 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  34.28 
 
 		 1104 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  33.92 
 
 		 1225 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  35.35 
 
 		 1108 aa  498  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  35.51 
 
 		 1108 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  35.12 
 
 		 1108 aa  496  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  35.11 
 
 		 1108 aa  492  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  35.22 
 
 		 1108 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl583  DNA polymerase III alpha subunit  37.39 
 
 		 992 aa  491  1e-137  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  35.29 
 
 		 1108 aa  491  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  35.22 
 
 		 1108 aa  492  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  35.22 
 
 		 1108 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  33.18 
 
 		 1145 aa  493  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  34.95 
 
 		 1110 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  35.22 
 
 		 1108 aa  492  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  33.19 
 
 		 1175 aa  493  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  33.41 
 
 		 1130 aa  488  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0872  DNA polymerase III subunit alpha  33.48 
 
 		 1161 aa  489  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.224124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  32.74 
 
 		 1155 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  33.66 
 
 		 1145 aa  485  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1742  DNA polymerase III subunit alpha  33.22 
 
 		 1179 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209003  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0921  DNA polymerase III subunit alpha  33.01 
 
 		 1165 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  40.28 
 
 		 1127 aa  484  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  31.74 
 
 		 1151 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  32.71 
 
 		 1151 aa  482  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1375  DNA polymerase III subunit alpha  33.08 
 
 		 1165 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0819  DNA polymerase III subunit alpha  39.51 
 
 		 1163 aa  479  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  39.66 
 
 		 1163 aa  478  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1283  DNA polymerase III subunit alpha  39.63 
 
 		 1165 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197401  normal  0.0648697 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  31.72 
 
 		 1173 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  32.6 
 
 		 1168 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  31.6 
 
 		 1155 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  38.01 
 
 		 1172 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  32.72 
 
 		 1217 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  37.1 
 
 		 1115 aa  476  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2402  DNA polymerase III subunit alpha  38.96 
 
 		 1163 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  32.76 
 
 		 1149 aa  473  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4284  DNA polymerase III subunit alpha  31.09 
 
 		 1150 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.166792 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  32.63 
 
 		 1165 aa  475  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  32.08 
 
 		 1179 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0637  DNA-directed DNA polymerase III (polc)  34.85 
 
 		 986 aa  474  1e-132  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0459907  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1378  DNA polymerase III subunit alpha  32.18 
 
 		 1147 aa  475  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.450591  normal  0.182438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3197  DNA polymerase III, alpha subunit  32.63 
 
 		 1139 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  32.41 
 
 		 1168 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  31.24 
 
 		 1156 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  31.9 
 
 		 1134 aa  473  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3270  DNA polymerase III subunit alpha  32.05 
 
 		 1151 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  34.3 
 
 		 1151 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2808  DNA polymerase III subunit alpha  39.12 
 
 		 1143 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.30719  normal  0.975511 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3553  DNA polymerase III subunit alpha  31.94 
 
 		 1163 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3236  DNA polymerase III subunit alpha  30.99 
 
 		 1163 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  30.54 
 
 		 1156 aa  468  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  32.1 
 
 		 1210 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3525  DNA polymerase III, alpha subunit  32.1 
 
 		 1210 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  31.25 
 
 		 1164 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3949  DNA polymerase III subunit alpha  31.09 
 
 		 1163 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  unclonable  0.0040384  normal  0.125075 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  32.04 
 
 		 1184 aa  469  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1762  DNA polymerase III subunit alpha  38.02 
 
 		 1156 aa  468  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402462  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3593  DNA polymerase III, alpha subunit  32.1 
 
 		 1210 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4522  DNA polymerase III subunit alpha  37.3 
 
 		 1173 aa  465  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2126  DNA polymerase III subunit alpha  41.4 
 
 		 1257 aa  463  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.794686  normal  0.520943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2034  DNA polymerase III, alpha subunit  30.97 
 
 		 1172 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  30.81 
 
 		 1155 aa  465  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  31.01 
 
 		 1165 aa  463  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7295  DNA polymerase III, alpha subunit  31.58 
 
 		 1158 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20831  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  32.38 
 
 		 1160 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  31.26 
 
 		 1159 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  34.55 
 
 		 1186 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0460  DNA polymerase III DnaE  35.91 
 
 		 969 aa  461  9.999999999999999e-129  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  33.19 
 
 		 1156 aa  459  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  32.89 
 
 		 1148 aa  456  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0500  DNA polymerase III subunit alpha  31.3 
 
 		 1166 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0751072  normal  0.378075 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  32.53 
 
 		 1165 aa  458  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  32.96 
 
 		 1159 aa  458  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1596  DNA polymerase III, alpha subunit  32.55 
 
 		 1159 aa  455  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0940  DNA polymerase III subunit alpha  36.21 
 
 		 1155 aa  455  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863457 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  32.58 
 
 		 1186 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  33.33 
 
 		 1149 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  33.44 
 
 		 1331 aa  456  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  32.1 
 
 		 1174 aa  452  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2205  DNA polymerase III subunit alpha  33.44 
 
 		 1173 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  30.88 
 
 		 1183 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  32.5 
 
 		 1182 aa  451  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  32.21 
 
 		 1167 aa  450  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  38.85 
 
 		 1159 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1698  DNA polymerase III, alpha subunit  31.2 
 
 		 1152 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235655 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  32 
 
 		 1172 aa  448  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  32.86 
 
 		 1162 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0922  DNA polymerase III, alpha subunit  32.28 
 
 		 1120 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>