79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03168 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  100 
 
 		 347 aa  687    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  55.33 
 
 		 321 aa  279  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  49.15 
 
 		 307 aa  250  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  46.98 
 
 		 311 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.07 
 
 		 319 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  45.42 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  46.89 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.64 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  32.22 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  34.98 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  34.8 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.88 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.59 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.15 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 		 282 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 		 301 aa  92.8  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  31.62 
 
 		 301 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.88 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.23 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  31.02 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  29.02 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  27.37 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.37 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  28.27 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.57 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  27.72 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  26.33 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  26.04 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  23.57 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  23.67 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  25.7 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  23.23 
 
 		 309 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 		 293 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  23.23 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.41 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  23.67 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  22.46 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  27.05 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  23.9 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 		 282 aa  50.1  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  27.45 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  23.25 
 
 		 322 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.26 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  21.86 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4552  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.97 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  24.26 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  26.16 
 
 		 290 aa  47  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  29.7 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  22.61 
 
 		 322 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.25 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  22.03 
 
 		 309 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  26.64 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  26.19 
 
 		 307 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  25 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.62 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  22.61 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4181  hypothetical protein  22.85 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.97 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  23.89 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  20.47 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  26.04 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  20.86 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  26.32 
 
 		 303 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  38.81 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  22.6 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.61 
 
 		 302 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  26.27 
 
 		 305 aa  43.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  25.46 
 
 		 273 aa  42.7  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 		 300 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.14 
 
 		 303 aa  42.7  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  17.73 
 
 		 287 aa  42.7  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>