More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00386 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00386  putative sensor transduction kinase (copper resistance)  100 
 
 
479 aa  980    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0799  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.22 
 
 
493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0355  membrane associated sensor histidine kinase  33.33 
 
 
479 aa  263  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.127376  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0239  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
478 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2713  sensor histidine kinase  33.4 
 
 
479 aa  246  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.725712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 
470 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
467 aa  93.2  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0704  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
490 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.65645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
467 aa  90.9  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1730  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
479 aa  90.1  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3707  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.72 
 
 
482 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 
500 aa  88.6  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1092  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 
464 aa  88.2  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 
478 aa  88.2  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 
462 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.5 
 
 
494 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.29 
 
 
482 aa  87.4  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  23.67 
 
 
466 aa  86.7  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5872  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
485 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617315  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2713  histidine kinase  22.85 
 
 
470 aa  86.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 
500 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4077  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
494 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134335  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 
463 aa  84.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  24.68 
 
 
446 aa  84.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4289  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
494 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.85 
 
 
459 aa  83.6  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3015  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.65 
 
 
470 aa  83.6  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 
472 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
495 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  21.86 
 
 
465 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 
473 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 
472 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 
472 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.9 
 
 
480 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
478 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  24.75 
 
 
472 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 
462 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  26.39 
 
 
463 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 
469 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  28.17 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  23.68 
 
 
482 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6518  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
484 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.38 
 
 
465 aa  81.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4316  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 
485 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.500539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
477 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2068  heavy metal sensor signal transduction histidine Kinases (STHK)  27.74 
 
 
484 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178003  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  26.81 
 
 
462 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  24.53 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  23.9 
 
 
480 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  24.61 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  24.61 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  23.33 
 
 
477 aa  80.5  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  26.91 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  24.78 
 
 
463 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1597  signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
495 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 
441 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.15 
 
 
467 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  24.54 
 
 
592 aa  78.2  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2515  histidine kinase  24.3 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  28.46 
 
 
478 aa  78.2  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  24.21 
 
 
475 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  28.46 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  22.83 
 
 
420 aa  77.8  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0703  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 
495 aa  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  24.3 
 
 
482 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 
469 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  23.33 
 
 
483 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
468 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
468 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
468 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1491  histidine kinase  26.02 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  21.76 
 
 
447 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.85 
 
 
480 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  21.02 
 
 
455 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  25.93 
 
 
468 aa  75.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 
458 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  25.27 
 
 
436 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.77 
 
 
467 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  23.29 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  23.93 
 
 
473 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.08 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  24.66 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  25.75 
 
 
467 aa  75.1  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  25.48 
 
 
454 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5865  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 
465 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  24.11 
 
 
436 aa  74.3  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5470  histidine kinase  23.69 
 
 
467 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0102378  hitchhiker  0.00183313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  23.03 
 
 
463 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  21.94 
 
 
469 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  23.68 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1385  histidine kinase  23.98 
 
 
603 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.643671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  20.92 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  24.2 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>