More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00220 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00220  putative heat shock protein 70 family protein  100 
 
 
500 aa  1028    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2983  putative heat shock protein 70 family protein  66.47 
 
 
501 aa  694    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0515  putative heat shock protein 70 family protein  38.36 
 
 
437 aa  271  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.733871 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  35.87 
 
 
475 aa  266  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  33.2 
 
 
457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  32.19 
 
 
452 aa  238  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  33.07 
 
 
455 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  35.18 
 
 
454 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  31.56 
 
 
484 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  31.56 
 
 
484 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  32.54 
 
 
461 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  34.01 
 
 
484 aa  227  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2656  putative chaperone  39.01 
 
 
459 aa  226  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  33.41 
 
 
489 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  33.8 
 
 
418 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  33.18 
 
 
490 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  34.84 
 
 
484 aa  224  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  35.39 
 
 
450 aa  224  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  35.38 
 
 
456 aa  223  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  33.41 
 
 
490 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  36.77 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  33.18 
 
 
490 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  35.1 
 
 
456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  36.77 
 
 
450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  36.49 
 
 
450 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  36.49 
 
 
450 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  36.77 
 
 
450 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  35.25 
 
 
450 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  35.56 
 
 
450 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  36.21 
 
 
450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.690731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  36.21 
 
 
450 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  35.93 
 
 
450 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  36.21 
 
 
450 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  35.93 
 
 
450 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  35.93 
 
 
450 aa  217  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  36.21 
 
 
450 aa  216  8e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  34.82 
 
 
450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  34.69 
 
 
450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  33.56 
 
 
488 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  35.38 
 
 
450 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  34.54 
 
 
450 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  34.54 
 
 
450 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  35.38 
 
 
450 aa  210  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  35.65 
 
 
450 aa  210  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  34.54 
 
 
449 aa  206  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2404  putative chaperone  35.22 
 
 
468 aa  206  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000139082  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1614  putative chaperone  34.26 
 
 
449 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  34.54 
 
 
450 aa  199  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  33.52 
 
 
456 aa  195  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  32.58 
 
 
418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  29.64 
 
 
421 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1615  heat shock protein  30.32 
 
 
503 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  30.99 
 
 
417 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  29.4 
 
 
421 aa  156  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  30.49 
 
 
417 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  29.86 
 
 
423 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01756  heat shock protein  26.39 
 
 
458 aa  154  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.322701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  29.86 
 
 
423 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  30.83 
 
 
425 aa  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  29.86 
 
 
423 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2937  heat shock protein  27.49 
 
 
453 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4506  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  32.58 
 
 
416 aa  150  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  29.89 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  30.29 
 
 
419 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  29.01 
 
 
424 aa  147  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  29.89 
 
 
420 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  30.53 
 
 
415 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  30.61 
 
 
421 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  28.38 
 
 
421 aa  144  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  30.19 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  29.69 
 
 
437 aa  141  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  27.89 
 
 
417 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  29.69 
 
 
415 aa  140  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  30.52 
 
 
420 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  27.25 
 
 
417 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  30.3 
 
 
421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  28.98 
 
 
419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  29.89 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  29.71 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  26.98 
 
 
425 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  28.95 
 
 
415 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  27.25 
 
 
421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  31.23 
 
 
443 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  27.64 
 
 
419 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  27.66 
 
 
416 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  28.19 
 
 
432 aa  123  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  28.37 
 
 
415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  27.97 
 
 
416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  26.88 
 
 
422 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  28.5 
 
 
416 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  28.23 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  28.16 
 
 
496 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  28.16 
 
 
435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  27.97 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  27.97 
 
 
416 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  28.93 
 
 
471 aa  117  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  31.56 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  29.11 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  28.17 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  30.25 
 
 
414 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>