More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4799 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4799  amidase  100 
 
 		 414 aa  794    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4589  Amidase  85.27 
 
 		 414 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0916  amidase  69.57 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0852  Amidase  71.01 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0877  Amidase  68.6 
 
 		 411 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2263  amidase  65.22 
 
 		 410 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241532  normal  0.548827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1323  amidase  60.28 
 
 		 421 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1306  putative amidase  49.04 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.902626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3290  amidase  46.56 
 
 		 431 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3603  malonamidase E2  52.84 
 
 		 433 aa  262  8e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5904  amidase  50.7 
 
 		 427 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424342  normal  0.115898 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1032  amidase  42.25 
 
 		 436 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.516301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2453  amidase  45.18 
 
 		 467 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.205936  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2779  Amidase  45.33 
 
 		 425 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3419  amidase  45.43 
 
 		 441 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0309  putative amidase (amiD)  44.47 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.613123  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3331  amidase  41.55 
 
 		 428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7127  hypothetical protein  43.35 
 
 		 436 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6302  amidase  43.4 
 
 		 457 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1179  amidase  38.3 
 
 		 433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3015  amidase  46.44 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3369  Asp-tRNA Asn/Glu-tRNA Gln amidotransferase subunit A  46.44 
 
 		 452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3870  2-alkenal reductase  44.59 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.80719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0343  amidase  42.93 
 
 		 450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1832  amidase  34.74 
 
 		 429 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119712  normal  0.725364 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11219  amidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14410)  35.53 
 
 		 442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.016892  normal  0.194738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1839  Amidase  38.4 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0798  Amidase  38.38 
 
 		 424 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4393  amidase  36.9 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.43 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0184  amidase  36.8 
 
 		 480 aa  146  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.22 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.36 
 
 		 479 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  31.22 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.05 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.18 
 
 		 498 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1115  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.6 
 
 		 485 aa  139  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00160205  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1020  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.7 
 
 		 487 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00154188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  30.81 
 
 		 472 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.8 
 
 		 483 aa  136  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0208  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.37 
 
 		 453 aa  135  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.382536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.96 
 
 		 475 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02330  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.66 
 
 		 477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.313614  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.7 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  31.22 
 
 		 464 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3153  amidase  37.47 
 
 		 412 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389149 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  35.21 
 
 		 467 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4296  amidase  35.2 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.581919 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  32.8 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  34.28 
 
 		 463 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.03 
 
 		 487 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1541  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  30.49 
 
 		 486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.859243  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.68 
 
 		 485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13411  amidase amiD (acylamidase)  32.42 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  35.04 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.14 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.75 
 
 		 485 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  36.27 
 
 		 473 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0857  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.53 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1547  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.03 
 
 		 472 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.55 
 
 		 495 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  33.09 
 
 		 476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  34.53 
 
 		 454 aa  127  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  30.11 
 
 		 491 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  32.32 
 
 		 511 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0231  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.54 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.747986  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  34.19 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  28.79 
 
 		 549 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  35.13 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  34.42 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.08 
 
 		 486 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.73 
 
 		 482 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0237  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.3 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.780008 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1302  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.6 
 
 		 491 aa  124  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.584243  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1499  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.57 
 
 		 472 aa  124  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000099116  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.08 
 
 		 486 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.69 
 
 		 485 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  33.69 
 
 		 461 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1917  hypothetical protein  27.32 
 
 		 494 aa  123  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.36 
 
 		 485 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  32.2 
 
 		 458 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0346  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.37 
 
 		 482 aa  122  9e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0113738  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  32.21 
 
 		 492 aa  122  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1194  Amidase  35.96 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0374201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  26.95 
 
 		 491 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.63 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  39.22 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  33.65 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.6 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0085  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.64 
 
 		 496 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  32.59 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.23 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4787  Amidase  36.86 
 
 		 516 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1505  Amidase  34.26 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.44 
 
 		 491 aa  121  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  28.1 
 
 		 486 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.98 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4342  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.22 
 
 		 492 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2838  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.08 
 
 		 501 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.81 
 
 		 482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>