More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6302 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6302  amidase  100 
 
 
457 aa  913    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0309  putative amidase (amiD)  49.63 
 
 
448 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.613123  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2779  Amidase  48.24 
 
 
425 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1179  amidase  43.98 
 
 
433 aa  307  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3331  amidase  44.69 
 
 
428 aa  231  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0343  amidase  45.11 
 
 
450 aa  227  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605191  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2453  amidase  41.91 
 
 
467 aa  219  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.205936  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3419  amidase  39.33 
 
 
441 aa  219  8.999999999999998e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1306  putative amidase  39.67 
 
 
438 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.902626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1832  amidase  35.9 
 
 
429 aa  209  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119712  normal  0.725364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1323  amidase  43.6 
 
 
421 aa  209  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1032  amidase  39.78 
 
 
436 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.516301  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2263  amidase  40.56 
 
 
410 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241532  normal  0.548827 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5904  amidase  38.12 
 
 
427 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424342  normal  0.115898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4589  Amidase  42.86 
 
 
414 aa  200  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0916  amidase  41.36 
 
 
413 aa  199  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0852  Amidase  42.07 
 
 
434 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7127  hypothetical protein  36.87 
 
 
436 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0877  Amidase  40.88 
 
 
411 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4799  amidase  42.86 
 
 
414 aa  194  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3870  2-alkenal reductase  39.03 
 
 
454 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.80719  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3290  amidase  37.86 
 
 
431 aa  186  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3015  amidase  41.22 
 
 
452 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3369  Asp-tRNA Asn/Glu-tRNA Gln amidotransferase subunit A  41.22 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3603  malonamidase E2  41.23 
 
 
433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0798  Amidase  37.7 
 
 
424 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1839  Amidase  35.66 
 
 
436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33 
 
 
475 aa  163  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  36.26 
 
 
461 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.6 
 
 
480 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  34.13 
 
 
454 aa  161  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  36.08 
 
 
468 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4393  amidase  34.71 
 
 
450 aa  156  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281674  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11219  amidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14410)  32.27 
 
 
442 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.016892  normal  0.194738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  31.29 
 
 
466 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.87 
 
 
483 aa  151  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.23 
 
 
485 aa  149  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  32.7 
 
 
466 aa  149  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  32.03 
 
 
445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0184  amidase  33.42 
 
 
480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  30.44 
 
 
534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.86 
 
 
475 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 
491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  33.67 
 
 
447 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5308  amidase  35.08 
 
 
466 aa  147  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2332  amidase  32.61 
 
 
542 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1118  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.84 
 
 
505 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00327681  hitchhiker  0.000372157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.58 
 
 
498 aa  144  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13411  amidase amiD (acylamidase)  30.11 
 
 
475 aa  144  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1384  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.05 
 
 
506 aa  143  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  30.53 
 
 
470 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.43 
 
 
483 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  33.16 
 
 
461 aa  143  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1547  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.8 
 
 
472 aa  143  8e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460524  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.64 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1499  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.8 
 
 
472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000099116  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.98 
 
 
495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1302  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.85 
 
 
491 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.584243  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02330  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.56 
 
 
477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.313614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  31.76 
 
 
472 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.98 
 
 
499 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.39 
 
 
486 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2838  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.68 
 
 
501 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  30.75 
 
 
477 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7043  indole acetimide hydrolase  35.39 
 
 
500 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.445138 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.93 
 
 
484 aa  140  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.35 
 
 
486 aa  140  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  28.85 
 
 
491 aa  139  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.83 
 
 
486 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.67 
 
 
486 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  34.94 
 
 
463 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  27.96 
 
 
486 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.83 
 
 
486 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  29.41 
 
 
466 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0271  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.57 
 
 
491 aa  138  2e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0231  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.57 
 
 
500 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.747986  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  34.1 
 
 
470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  34.65 
 
 
477 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.68 
 
 
491 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0346  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.09 
 
 
482 aa  137  4e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0113738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.09 
 
 
489 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4188  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.33 
 
 
492 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.834018  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0237  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.57 
 
 
500 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.780008 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  33.73 
 
 
463 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.42 
 
 
483 aa  136  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.3 
 
 
482 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0710  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.57 
 
 
485 aa  136  8e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1453  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.12 
 
 
477 aa  136  8e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.67645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  31.22 
 
 
511 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.31 
 
 
479 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.03 
 
 
487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.19 
 
 
485 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.75 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10590  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.25 
 
 
503 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.701412  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0085  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.9 
 
 
496 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  31.78 
 
 
458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  34.18 
 
 
486 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  32.1 
 
 
470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.15 
 
 
463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  30.6 
 
 
472 aa  134  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>