More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0343 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0343  amidase  100 
 
 		 450 aa  896    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605191  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3870  2-alkenal reductase  57.24 
 
 		 454 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.80719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3369  Asp-tRNA Asn/Glu-tRNA Gln amidotransferase subunit A  57.34 
 
 		 452 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3015  amidase  57.34 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3419  amidase  48.08 
 
 		 441 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1032  amidase  42.25 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.516301  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1179  amidase  38.44 
 
 		 433 aa  276  7e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0309  putative amidase (amiD)  45.23 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.613123  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2453  amidase  43.71 
 
 		 467 aa  273  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.205936  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2779  Amidase  43.32 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3331  amidase  41.01 
 
 		 428 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7127  hypothetical protein  38.26 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6302  amidase  45.11 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1832  amidase  38.18 
 
 		 429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119712  normal  0.725364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3290  amidase  39.34 
 
 		 431 aa  230  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3603  malonamidase E2  42.62 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2263  amidase  39.95 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241532  normal  0.548827 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11219  amidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14410)  35.37 
 
 		 442 aa  212  9e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.016892  normal  0.194738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  34.99 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1306  putative amidase  37.3 
 
 		 438 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.902626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  36.78 
 
 		 461 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.14 
 
 		 491 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.41 
 
 		 480 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1323  amidase  39.49 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.72 
 
 		 485 aa  190  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5904  amidase  39.12 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424342  normal  0.115898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  35.24 
 
 		 599 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0916  amidase  40.09 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0877  Amidase  39.53 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.67 
 
 		 491 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1112  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.49 
 
 		 491 aa  183  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.881874  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.81 
 
 		 463 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.67 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  35.19 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4799  amidase  42.2 
 
 		 414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0184  amidase  35.14 
 
 		 480 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2332  amidase  34.24 
 
 		 542 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10590  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.11 
 
 		 503 aa  180  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.701412  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.33 
 
 		 484 aa  179  9e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.36 
 
 		 479 aa  179  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1033  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.89 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1227  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.75 
 
 		 475 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0852  Amidase  39.19 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.89 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  30.8 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.17 
 
 		 489 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4320  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.92 
 
 		 492 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0782  amidohydrolase, AtzE family  34.44 
 
 		 465 aa  176  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0925  amidohydrolase, AtzE family  34.44 
 
 		 465 aa  176  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.99 
 
 		 512 aa  176  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.19 
 
 		 485 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  35.19 
 
 		 534 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.12 
 
 		 505 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.18 
 
 		 479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4188  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.4 
 
 		 492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.834018  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.82 
 
 		 475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1839  Amidase  40.27 
 
 		 436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4342  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.71 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  32.82 
 
 		 447 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  35.32 
 
 		 487 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  35.49 
 
 		 599 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  32.61 
 
 		 477 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.79 
 
 		 482 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.67 
 
 		 485 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.59 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  32.26 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0928  amidase  33.56 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.18 
 
 		 470 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.13 
 
 		 486 aa  171  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1118  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.48 
 
 		 505 aa  171  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00327681  hitchhiker  0.000372157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  31.49 
 
 		 549 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4434  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  32.55 
 
 		 486 aa  171  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.689377  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.54 
 
 		 486 aa  170  6e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0798  Amidase  37.97 
 
 		 424 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  31.47 
 
 		 457 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.6 
 
 		 475 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0873  amidase  34.2 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.753798  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.56 
 
 		 479 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  34.57 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1318  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.38 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  34 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.99 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  33.86 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.31 
 
 		 488 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0163  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.51 
 
 		 499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13411  amidase amiD (acylamidase)  32.74 
 
 		 475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  32.76 
 
 		 472 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0085  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.88 
 
 		 496 aa  167  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  32.67 
 
 		 466 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0653  amidase  35.63 
 
 		 466 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4656  amidase  33.92 
 
 		 482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292034  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.57 
 
 		 482 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.98 
 
 		 486 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1541  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.32 
 
 		 486 aa  166  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.859243  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1438  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.09 
 
 		 485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1700  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.6 
 
 		 483 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  33.41 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  33.26 
 
 		 463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1580  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.52 
 
 		 488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1701  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.32 
 
 		 483 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>