More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1837 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1837  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 217 aa  456  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1293  phosphoglycerate mutase family protein  52.09 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0371  phosphoglycerate mutase family protein  53.15 
 
 		 224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0619  phosphoglycerate mutase family protein  55.22 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1692  phosphoglycerate mutase family protein  47.64 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.730655  hitchhiker  5.23807e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  42.52 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  37.67 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0239  phosphoglycerate mutase  37.96 
 
 		 218 aa  153  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0382  phosphoglycerate mutase family protein  37.56 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000714196  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0327  phosphoglycerate mutase family protein  35.94 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000103496  hitchhiker  7.17223e-17 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1441  phosphoglycerate mutase family protein  34.21 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3203  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3513  putative phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3287  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3257  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3502  putative phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3545  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3497  phosphoglycerate mutase, putative  30.73 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0029752  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2546  Phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3194  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0874963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1765  putative phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0485881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 253 aa  96.3  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3484  putative phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0311  Phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 		 260 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  34.43 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0665  Phosphoglycerate mutase  31.08 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392095  hitchhiker  0.00083229 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1051  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1025  phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000345581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  28.73 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1371  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1022  phosphoglycerate mutase  29.36 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  27.06 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0158  fructose-2,6-bisphosphatase  35.92 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000695658  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  32.21 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0310  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0092  phosphoglycerate mutase family protein  36.73 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2156  Phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.11 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  28.18 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  30.86 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  28.8 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  25.59 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  26.97 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  37.76 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  41.94 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  39.78 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  38.78 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1596  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0120302  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  39.78 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  37.76 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  27.36 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  27.93 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.09 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0291  phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0246325  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  25.23 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  25.66 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  26.89 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  27.62 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  25.84 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  34.26 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  29.79 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  25.13 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  25.65 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0095  phosphoglyceromutase  27.04 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.597303  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0752  phosphoglycerate mutase family protein  29.06 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>