147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0480 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0854  L-ribulokinase (putative)  56.6 
 
 		 539 aa  639    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0480  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 540 aa  1112    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.50905  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1020  putative L-ribulokinase  55.95 
 
 		 548 aa  627  1e-178  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1145  carbohydrate kinase FGGY  53.6 
 
 		 532 aa  616  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0227  L-ribulokinase (putative)  55 
 
 		 532 aa  607  9.999999999999999e-173  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3468  carbohydrate kinase FGGY  51.14 
 
 		 535 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0242  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  52.41 
 
 		 531 aa  568  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14138  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0034  sugar kinase  50.58 
 
 		 530 aa  568  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29500  pentulose/hexulose kinase  50.47 
 
 		 546 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2755  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  52.13 
 
 		 538 aa  560  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.018415  decreased coverage  0.00000370584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0496  carbohydrate kinase FGGY  50.66 
 
 		 539 aa  541  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.906538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0401  carbohydrate kinase FGGY  52 
 
 		 537 aa  530  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42527  predicted protein  28.63 
 
 		 522 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000294856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.51 
 
 		 500 aa  99.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  23.31 
 
 		 509 aa  88.2  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  23.35 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  20.57 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  22.68 
 
 		 518 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  21.25 
 
 		 493 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  22.18 
 
 		 493 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  21.77 
 
 		 499 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  21.19 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  21.54 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  23.04 
 
 		 511 aa  67  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  24.36 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  24.23 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  20.59 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  24.83 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  24.83 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  23.55 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  23.76 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  23.02 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  23.02 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  22.83 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  23.19 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  20.53 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  21.62 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  23.19 
 
 		 493 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  26.39 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  22.83 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  21.02 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  25.33 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  25.33 
 
 		 486 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  22.52 
 
 		 498 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  22.55 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  25.82 
 
 		 485 aa  59.7  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  21.96 
 
 		 496 aa  59.7  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  23.93 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  23.93 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  23.93 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  23.93 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  22.13 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  23.93 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  22.35 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  25.69 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  25.69 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  25.69 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  25.69 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  21.69 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  23.13 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  22.67 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  22.53 
 
 		 493 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  25.33 
 
 		 486 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  19.65 
 
 		 501 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  21.84 
 
 		 481 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  22.35 
 
 		 502 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4109  carbohydrate kinase FGGY  21.2 
 
 		 494 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  22.06 
 
 		 515 aa  55.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  22.1 
 
 		 494 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  23.46 
 
 		 512 aa  54.3  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  21.84 
 
 		 499 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  22.28 
 
 		 458 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1803  carbohydrate kinase  23 
 
 		 505 aa  53.5  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  24.29 
 
 		 493 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  23.88 
 
 		 488 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  23.88 
 
 		 488 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  24.29 
 
 		 493 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  24.29 
 
 		 493 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  29.41 
 
 		 505 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  22.64 
 
 		 484 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  20.43 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  23.68 
 
 		 488 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  21.06 
 
 		 509 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  23.15 
 
 		 488 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  23.68 
 
 		 486 aa  50.8  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  23.08 
 
 		 486 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  23.78 
 
 		 484 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  21.83 
 
 		 503 aa  50.4  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  21.1 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  26.23 
 
 		 488 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  22.34 
 
 		 493 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  21.31 
 
 		 491 aa  50.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  25.09 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  21.06 
 
 		 490 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  24.39 
 
 		 514 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  21.43 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  21.43 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  23.11 
 
 		 489 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  21.36 
 
 		 465 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  20.48 
 
 		 505 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>