More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0989 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0866  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 307 aa  621  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0989  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 307 aa  621  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179593 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0958  transcriptional regulator, LysR family  44.03 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.181705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0817  transcriptional regulator, LysR family  44.03 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0172  transcriptional regulator, LysR family  48.46 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0351  transcriptional regulator, LysR family  48.46 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.363543  normal  0.665208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 289 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2243  LysR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1524  LysR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1978  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  0.0418865 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2099  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 300 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2291  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 300 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2158  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 300 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0300496  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1255  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1735  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6344  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1748  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.8769 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2293  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1656  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.191617  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0958  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5031  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.361143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2280  transcriptional regulator, LysR family  37.99 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1656  LysR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2840  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1662  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1993  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223319  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 329 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4836  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  33.88 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1091  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1597  putative transcriptional regulator LysR-type  28.43 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  30.92 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 327 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 327 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  30.35 
 
 		 336 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0634  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  31.62 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  33.73 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1449  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 337 aa  113  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4872  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.511733  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  34.85 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2350  transcriptional regulator, LysR family  26.92 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  28.83 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02040  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.65232  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  30.36 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  30.22 
 
 		 320 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  30.22 
 
 		 320 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  28.19 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  28.19 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0434  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1513  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1245  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000547224  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01641  putative Rubisco transcriptional regulator  30.36 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.569388  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  28.19 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2047  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  29.55 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.595043  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01661  putative Rubisco transcriptional regulator  30.36 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  26.54 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  26.54 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 314 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  29.76 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2817  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2957  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.549224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2625  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.172216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  28.9 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23140  transcriptional regulator CysB  30.38 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  29.19 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>