More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0663 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  100 
 
 		 407 aa  815    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  53.81 
 
 		 439 aa  401  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  51.51 
 
 		 441 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  53.03 
 
 		 437 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  44.72 
 
 		 444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  42.4 
 
 		 445 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  43.25 
 
 		 446 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  43.61 
 
 		 461 aa  299  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  41.01 
 
 		 460 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  40.77 
 
 		 468 aa  292  6e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  42.71 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  39.39 
 
 		 478 aa  290  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  39.21 
 
 		 478 aa  289  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  40.68 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  41.41 
 
 		 644 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  42.31 
 
 		 458 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.9 
 
 		 1018 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 717 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  39.95 
 
 		 483 aa  280  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  41.06 
 
 		 441 aa  279  6e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2151  ammonium transporter  41.86 
 
 		 611 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.51 
 
 		 1262 aa  278  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  39.18 
 
 		 471 aa  276  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  39.8 
 
 		 1209 aa  276  7e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  40.92 
 
 		 435 aa  275  9e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  40.92 
 
 		 435 aa  275  9e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  42.25 
 
 		 408 aa  273  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.51 
 
 		 1016 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  41.9 
 
 		 422 aa  268  8.999999999999999e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  39.42 
 
 		 476 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  40.88 
 
 		 461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  38.61 
 
 		 417 aa  266  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  40.45 
 
 		 1322 aa  265  8e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.85 
 
 		 1264 aa  263  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  38.17 
 
 		 469 aa  260  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6567  ammonium transporter  38.26 
 
 		 474 aa  256  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  41.34 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  38.55 
 
 		 486 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  38.55 
 
 		 486 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  39.57 
 
 		 426 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  37.44 
 
 		 525 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  37.83 
 
 		 486 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  37.65 
 
 		 497 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  37.28 
 
 		 414 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  41.18 
 
 		 462 aa  249  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  38.38 
 
 		 416 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  38.38 
 
 		 416 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  38.38 
 
 		 416 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  39.14 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  39.14 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  38.64 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  39.24 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  39.14 
 
 		 416 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2892  ammonium transporter  39.24 
 
 		 404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0140736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  39.95 
 
 		 421 aa  246  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  38.81 
 
 		 441 aa  245  8e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  39.49 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  39.9 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  35.93 
 
 		 506 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  38.94 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  38.69 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  35.93 
 
 		 487 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  35.65 
 
 		 482 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  37.62 
 
 		 496 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  37.62 
 
 		 496 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  37.8 
 
 		 490 aa  239  9e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  39.8 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  39.12 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  38.13 
 
 		 416 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  38.31 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  37.14 
 
 		 511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  35.28 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  38.55 
 
 		 509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  39.75 
 
 		 416 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54981  predicted protein  36.9 
 
 		 539 aa  234  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  39.3 
 
 		 441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  37.32 
 
 		 489 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  39.07 
 
 		 381 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000132513  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3162  Rh-like protein/ammonium transporter  39.5 
 
 		 416 aa  232  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0234598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  36.43 
 
 		 584 aa  232  9e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  39.35 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  39.9 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00480  putative ammonium transporter  41 
 
 		 415 aa  230  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  36.58 
 
 		 515 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  36.58 
 
 		 515 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  38.4 
 
 		 442 aa  230  4e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2407  ammonium transporter  39.95 
 
 		 414 aa  229  9e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4446  ammonium transporter  35.81 
 
 		 541 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  38.89 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  33.89 
 
 		 495 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  37.65 
 
 		 507 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  36.88 
 
 		 478 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  35.94 
 
 		 518 aa  226  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  37.65 
 
 		 507 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0643  Rh-like protein/ammonium transporter  35.92 
 
 		 391 aa  225  9e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.32832  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2156  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.72 
 
 		 904 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145891  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4745  ammonium transporter  35.35 
 
 		 514 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  37.18 
 
 		 506 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  36.36 
 
 		 489 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45928  Amt family transporter: ammonium  33.63 
 
 		 517 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.401156  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>