64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0298 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0298  methyltransferase type 11  100 
 
 		 263 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0605  hypothetical protein  56.84 
 
 		 237 aa  223  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1203  hypothetical protein  25 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.322275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 174 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.1 
 
 		 213 aa  48.9  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  30.23 
 
 		 377 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1851  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 203 aa  47.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  29.46 
 
 		 177 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  33.06 
 
 		 347 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2280  methyltransferase type 12  26.4 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  26.8 
 
 		 291 aa  46.2  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  28.68 
 
 		 174 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 201 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  25.96 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  31.58 
 
 		 829 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.58 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  30 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  30 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  33.75 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  27.94 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  31.3 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  30 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  34.83 
 
 		 832 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  30.84 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.23 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.2 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  24.14 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.38 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4190  Methyltransferase type 12  27.88 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278739  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2231  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  29.76 
 
 		 776 aa  42.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 233 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 204 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  26.45 
 
 		 360 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 239 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4875  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 297 aa  42.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  24.49 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.83 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.32 
 
 		 285 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 245 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>