More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2019 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  100 
 
 
293 aa  586  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  50.37 
 
 
308 aa  290  3e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  45 
 
 
303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  47.96 
 
 
296 aa  270  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  48.21 
 
 
308 aa  255  8e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  46.07 
 
 
297 aa  230  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  32.17 
 
 
330 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  31.79 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  33.46 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  35.02 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  35.02 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  35.02 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  34.62 
 
 
393 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.62 
 
 
320 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  34.48 
 
 
291 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.62 
 
 
320 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.62 
 
 
320 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.62 
 
 
312 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.23 
 
 
320 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  34.25 
 
 
304 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  34.54 
 
 
304 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  33.86 
 
 
304 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  31.72 
 
 
310 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  32.03 
 
 
294 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  38.1 
 
 
329 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  33.59 
 
 
333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  34.85 
 
 
324 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 
312 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  31.56 
 
 
317 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 
312 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  29.01 
 
 
330 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  31.21 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  26.62 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  29.43 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 
310 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  30.71 
 
 
398 aa  122  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  28.98 
 
 
298 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  32.32 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  29.64 
 
 
328 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  28.63 
 
 
306 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 
298 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 
298 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  27.86 
 
 
339 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  31.06 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  27.3 
 
 
343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  26.84 
 
 
321 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  31.15 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.16 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  26.41 
 
 
511 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  25.96 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1611  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  23.89 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  23.79 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  25.99 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  30.1 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  24.34 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  25.17 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  26.52 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1248  periplasmic solute binding protein  30.38 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  22.36 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  27 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  24.83 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  24.09 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  25.61 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  24.03 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  25.61 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  26.85 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  28.57 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  25.61 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  25.26 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  22.82 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  25.44 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  27.4 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  22.75 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  23.85 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  26.51 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  25.66 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  24 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  27.71 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  22.43 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  26.15 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1951  periplasmic solute binding protein  25.53 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0524661  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  26.15 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  26.15 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  23.48 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  23.7 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  26.15 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  21.57 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  26.15 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3801  periplasmic solute binding protein  28.5 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142921  normal  0.42718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2090  periplasmic solute binding protein  27.14 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1968  periplasmic solute binding protein  28.5 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0427869 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000836  cation ABC transporter cation-binding protein  25.42 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  27.17 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  25.56 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2141  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  24.89 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  22.12 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  24.76 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  24.23 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>