More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1148 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1148  Short-chain alcohol dehydrogenase  100 
 
 
253 aa  504  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0077  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  56.08 
 
 
260 aa  268  4e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.840544  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  51.56 
 
 
257 aa  260  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  51.38 
 
 
259 aa  259  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2541  acetoin reductases  53.36 
 
 
259 aa  258  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0776085  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  50.79 
 
 
258 aa  258  9e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  50.2 
 
 
259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  51.78 
 
 
259 aa  251  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  50.59 
 
 
256 aa  249  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  49.61 
 
 
257 aa  247  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  50.59 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  55.34 
 
 
259 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1602  acetoin reductase  54.55 
 
 
257 aa  241  6e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  50 
 
 
257 aa  241  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  50.2 
 
 
257 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0124  acetoin reductase  50 
 
 
264 aa  238  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172897  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0363  acetoin reductase  52.59 
 
 
232 aa  238  8e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  46.56 
 
 
268 aa  230  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0789  acetoin reductases  48.84 
 
 
264 aa  229  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.867312  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  47.84 
 
 
262 aa  229  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  48.41 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  47.67 
 
 
269 aa  218  7e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  46.18 
 
 
261 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  46.25 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  45.85 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4158  acetoin reductase  47.41 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436018  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  46.25 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  45.85 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  47.43 
 
 
254 aa  209  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  47.45 
 
 
259 aa  209  5e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  44.66 
 
 
258 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0638  acetoin reductases  46.33 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.140938  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0625  alcohol dehydrogenase family protein  46.33 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0750479  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0618  acetoin reductases  46.33 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  38.96 
 
 
260 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05373  conserved hypothetical protein  41.35 
 
 
274 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00512798  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  38.04 
 
 
260 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
261 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0184559 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.138148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  37.35 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  36.95 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  37.35 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  37.35 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  37.35 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  37.35 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  38.46 
 
 
257 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  37.35 
 
 
258 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  37.25 
 
 
260 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  37.35 
 
 
258 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  37.35 
 
 
258 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  36.55 
 
 
276 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  36.55 
 
 
276 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  36.55 
 
 
258 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  37.35 
 
 
258 aa  171  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2147  sorbitol dehydrogenase  37.75 
 
 
256 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000207425  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
261 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  36.14 
 
 
258 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
260 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
260 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  36.14 
 
 
258 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3571  sorbitol dehydrogenase  36.03 
 
 
258 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4813  sorbitol dehydrogenase  38.06 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  36.84 
 
 
262 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  36.44 
 
 
256 aa  165  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2354  sorbitol dehydrogenase  38.06 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
256 aa  165  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1731  sorbitol dehydrogenase  35.63 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311786  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0095  sorbitol dehydrogenase  36.03 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  36.51 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  36.03 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  36.44 
 
 
256 aa  158  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
247 aa  158  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
249 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2396  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36.58 
 
 
266 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
263 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
263 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814737  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
263 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.668551  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0269  sorbitol dehydrogenase  36.84 
 
 
263 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal  0.695361 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.89 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
260 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
253 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2737  acetoin dehydrogenase  35.32 
 
 
257 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
253 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.58 
 
 
246 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.58 
 
 
246 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2111  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
267 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00668393  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
244 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  38.87 
 
 
260 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.32 
 
 
247 aa  148  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0464  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
257 aa  148  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
280 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  37.3 
 
 
259 aa  146  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
240 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0400117  normal  0.51074 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
265 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>