More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0547 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0547  Kef-type K+ transport systems, membrane component  100 
 
 		 318 aa  602  1.0000000000000001e-171  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A26  Kef-type K+ transport systems, membrane component  60 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  36.36 
 
 		 379 aa  193  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  34.26 
 
 		 375 aa  189  4e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  30.53 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  29.41 
 
 		 375 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  29.41 
 
 		 375 aa  159  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  29.41 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  29.41 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  29.41 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  29.41 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  28.57 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  29.41 
 
 		 375 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  29.41 
 
 		 375 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  29.41 
 
 		 375 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  27.09 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  26.22 
 
 		 387 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  25.95 
 
 		 387 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  25.68 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  25.68 
 
 		 387 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  25.68 
 
 		 387 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  25.68 
 
 		 387 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  25.68 
 
 		 387 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  25.68 
 
 		 387 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  25.68 
 
 		 387 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.29 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  25.95 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  30.92 
 
 		 389 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  32.1 
 
 		 445 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  28.33 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  29.78 
 
 		 412 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  31.43 
 
 		 399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  29.71 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  29.01 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  37.5 
 
 		 386 aa  113  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  38.1 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  24.87 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  29.09 
 
 		 392 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  29.09 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 		 424 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  24.88 
 
 		 453 aa  99  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  35.16 
 
 		 396 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  25.66 
 
 		 424 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  27.15 
 
 		 388 aa  95.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 		 385 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  30.39 
 
 		 404 aa  92  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  31.72 
 
 		 412 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  25.75 
 
 		 491 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  25.43 
 
 		 473 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  38.67 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.15 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  38 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  26.04 
 
 		 485 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.66 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  26.1 
 
 		 399 aa  82.4  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  36 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  27.6 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  21.59 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  27.06 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  24.85 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  29.89 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  29.28 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  24.27 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  32.69 
 
 		 479 aa  75.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 		 398 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  36.99 
 
 		 414 aa  75.9  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  32.69 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  24.04 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  30.43 
 
 		 423 aa  72  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  24.62 
 
 		 513 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  27.92 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  22.83 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  24.15 
 
 		 398 aa  69.3  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  23.32 
 
 		 455 aa  68.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  21.98 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  29.49 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1031  sodium/hydrogen exchanger  23.94 
 
 		 386 aa  67  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.819756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  24.72 
 
 		 585 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  27.51 
 
 		 467 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  27.51 
 
 		 467 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  36.04 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  20.49 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  29.17 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  22.02 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  24.32 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0454  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 701 aa  63.5  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  34.19 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  23.48 
 
 		 609 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  26.13 
 
 		 614 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  26.13 
 
 		 614 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  28.66 
 
 		 767 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  34.29 
 
 		 750 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  26.82 
 
 		 413 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  34.23 
 
 		 650 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>