More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1523 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1523  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0722958  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.82 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  38.56 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.27 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  38.56 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  38.14 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  38.14 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  38.14 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  38.14 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  38.14 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  38.14 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  38.14 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  38.14 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 238 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.13 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  34.85 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  36.86 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.56 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  36.44 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  36.55 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  34.3 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  34.31 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  34.31 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  36.86 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  34.31 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  34.31 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  34.31 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  34.31 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  34.31 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  34.31 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  34.31 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  34.31 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  34.31 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  35.29 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  34.31 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.17 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.02 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.32 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.58 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  35.56 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  37.18 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 237 aa  148  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.15 
 
 		 237 aa  148  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.34 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  34.18 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  36.75 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  35.86 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  34.71 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  32.5 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  35.86 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0753  putative response regulator  34.2 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.33 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  34.75 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  34.75 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  36.64 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  35 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.31 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  34.47 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.47 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  35.86 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  38.14 
 
 		 232 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 232 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.24 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.54 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  34.89 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  34.18 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  34.18 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.2 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  35.27 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.91 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  32.35 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  32.07 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  37.71 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  36.05 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.44 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.98 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.48 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2671  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  32.64 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  32.75 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  32.64 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  35.84 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  32.78 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  34.6 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.07 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>