251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1025 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1025  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 
347 aa  705    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000723404  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0095  heat-inducible transcription repressor  45.95 
 
 
344 aa  333  3e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0161  heat-inducible transcription repressor  44.8 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00204123  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  30.35 
 
 
350 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1349  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.82 
 
 
341 aa  180  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0115435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  29.24 
 
 
344 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  27.78 
 
 
344 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  29.43 
 
 
352 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  27.41 
 
 
343 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  27.76 
 
 
338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  27.76 
 
 
338 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  27.76 
 
 
338 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  27.76 
 
 
338 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  27.63 
 
 
338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  27.76 
 
 
338 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  27.76 
 
 
338 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  27.63 
 
 
338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  27.63 
 
 
338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  27.63 
 
 
338 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.67 
 
 
347 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  31.5 
 
 
339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  31.5 
 
 
339 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.6 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  27.22 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  26.79 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  26.1 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1168  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.17 
 
 
337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.73 
 
 
350 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.29 
 
 
348 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.8 
 
 
350 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.37 
 
 
343 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  24.85 
 
 
340 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.57 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  26.59 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.62 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.07 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  24.56 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  26 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.36 
 
 
344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  24.56 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  24.56 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  28.96 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  24.56 
 
 
340 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  25.51 
 
 
339 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  24.56 
 
 
340 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  26.35 
 
 
337 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.07 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  26.38 
 
 
342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  25.15 
 
 
340 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  25.15 
 
 
340 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  25.15 
 
 
340 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  25.15 
 
 
340 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  25.15 
 
 
340 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  25.15 
 
 
385 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  25.15 
 
 
385 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2873  heat-inducible transcription repressor  26.09 
 
 
354 aa  119  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  24.78 
 
 
339 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  27.25 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  25.87 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  25.15 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  24.85 
 
 
340 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.72 
 
 
343 aa  116  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.53 
 
 
350 aa  116  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  25.59 
 
 
336 aa  116  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  26.15 
 
 
334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.57 
 
 
339 aa  115  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.78 
 
 
345 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.63 
 
 
342 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1220  heat-inducible transcription repressor  25.8 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2881  heat-inducible transcription repressor  25.8 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  26.93 
 
 
336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.14 
 
 
341 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  25.73 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.71 
 
 
343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2657  heat-inducible transcription repressor  25.22 
 
 
350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44913  normal  0.911216 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  25.15 
 
 
336 aa  113  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0207  heat-inducible transcription repressor  24.93 
 
 
354 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  24.49 
 
 
341 aa  113  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.18 
 
 
345 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  23.98 
 
 
342 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.22 
 
 
340 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  26.57 
 
 
334 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.46 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  26.87 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  24.71 
 
 
339 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3464  heat-inducible transcription repressor  25.22 
 
 
354 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  25.23 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  26.78 
 
 
362 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.57 
 
 
343 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  23.91 
 
 
342 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  26.52 
 
 
357 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.24 
 
 
337 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  26.91 
 
 
362 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.68 
 
 
351 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  27.07 
 
 
362 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.78 
 
 
347 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  24.92 
 
 
340 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  25.82 
 
 
341 aa  106  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.85 
 
 
342 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2417  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.25 
 
 
324 aa  106  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>