220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22490 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_22490  conserved hypothetical protein TIGR00149  100 
 
 		 155 aa  312  9.999999999999999e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.282378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7042  protein of unknown function UPF0047  67.91 
 
 		 135 aa  189  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2870  hypothetical protein  76.52 
 
 		 133 aa  187  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142366  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1363  protein of unknown function UPF0047  64.18 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1646  protein of unknown function UPF0047  68.89 
 
 		 135 aa  179  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1966  hypothetical protein  63.91 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387815  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5843  protein of unknown function UPF0047  74.42 
 
 		 135 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228828  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3372  hypothetical protein  60.58 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2358  hypothetical protein  63.43 
 
 		 135 aa  175  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0335235  normal  0.0190831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3056  hypothetical protein  70.9 
 
 		 134 aa  170  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3612  hypothetical protein  59.7 
 
 		 134 aa  169  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3395  hypothetical protein  59.7 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1861  hypothetical protein  72.22 
 
 		 129 aa  163  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0103013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2945  protein of unknown function UPF0047  68.66 
 
 		 135 aa  161  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10190  conserved hypothetical protein TIGR00149  66.91 
 
 		 136 aa  158  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1034  hypothetical protein  55.22 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0183321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2345  hypothetical protein  58.33 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.202939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2392  hypothetical protein  58.33 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2386  hypothetical protein  58.33 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2639  hypothetical protein  58.54 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3764  hypothetical protein  54.74 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12577  hypothetical protein  58.82 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0908128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0880  protein of unknown function UPF0047  46.97 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0539  protein of unknown function UPF0047  50.77 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  37.78 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  39.52 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  33.09 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  36.44 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  32.77 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  34.71 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  32.5 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  32.52 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  33.07 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  33.05 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  36.21 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  30.17 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  35.92 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  31.9 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  35.54 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  35.38 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  29.69 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  32.12 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  32.46 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  28.68 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  33.88 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  32.48 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  30.32 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  31.58 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  36.44 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  36.36 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  31.15 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  29.82 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  32.52 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  36.36 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  30.08 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  29.41 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  29.91 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  31.34 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  30.33 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  35.34 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  34.19 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  35.2 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  35.4 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  32.23 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  32.52 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  33.04 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  30.23 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  34.21 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  32.23 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  34.48 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  32.09 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  33.06 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  31.25 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  27.2 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  29.71 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  29.82 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  34.62 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  32.2 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  35.29 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  41.05 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  29.57 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  27.83 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  41.05 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  36.52 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  28.35 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2258  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.479021 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  29.31 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  36.36 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  31.62 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  32 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  41.05 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  26.27 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  33.6 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  26.83 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  26.67 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>