152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05760 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  100 
 
 		 755 aa  1499    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  43.29 
 
 		 726 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  44.1 
 
 		 706 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.75 
 
 		 691 aa  520  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  43.64 
 
 		 705 aa  502  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.99 
 
 		 705 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  41.21 
 
 		 761 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  39.33 
 
 		 799 aa  428  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.04 
 
 		 741 aa  308  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.76 
 
 		 732 aa  306  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 742 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.81 
 
 		 758 aa  304  5.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  35.4 
 
 		 759 aa  301  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.77 
 
 		 757 aa  300  7e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.85 
 
 		 747 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  33.06 
 
 		 742 aa  290  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  35.28 
 
 		 754 aa  290  9e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.48 
 
 		 767 aa  289  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  35.08 
 
 		 734 aa  289  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  34.29 
 
 		 795 aa  288  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.53 
 
 		 733 aa  287  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  34.86 
 
 		 776 aa  287  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.96 
 
 		 813 aa  286  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.29 
 
 		 746 aa  284  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.29 
 
 		 766 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  33.38 
 
 		 735 aa  279  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  31.1 
 
 		 758 aa  279  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  30.97 
 
 		 759 aa  278  3e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.75 
 
 		 788 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  34.05 
 
 		 726 aa  273  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  35.67 
 
 		 724 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  35.67 
 
 		 724 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  35.82 
 
 		 724 aa  270  8e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.83 
 
 		 748 aa  270  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  32.74 
 
 		 771 aa  266  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  31.76 
 
 		 829 aa  263  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  32.95 
 
 		 750 aa  248  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.54 
 
 		 693 aa  248  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.47 
 
 		 804 aa  244  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  31.98 
 
 		 874 aa  242  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  32.48 
 
 		 703 aa  233  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.81 
 
 		 672 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  31.52 
 
 		 692 aa  212  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  30.82 
 
 		 715 aa  211  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.29 
 
 		 732 aa  210  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.78 
 
 		 715 aa  210  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  31.82 
 
 		 716 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  31.2 
 
 		 666 aa  209  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  31.07 
 
 		 717 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.9 
 
 		 645 aa  205  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  32.67 
 
 		 695 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  44.66 
 
 		 765 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.19 
 
 		 659 aa  198  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.67 
 
 		 670 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.73 
 
 		 764 aa  196  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  30.22 
 
 		 706 aa  192  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  37.7 
 
 		 902 aa  187  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  30.23 
 
 		 680 aa  187  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  29.67 
 
 		 717 aa  187  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.6 
 
 		 832 aa  184  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  30.17 
 
 		 792 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.71 
 
 		 786 aa  177  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.14 
 
 		 710 aa  177  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  33.67 
 
 		 719 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.83 
 
 		 724 aa  172  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  27.93 
 
 		 1048 aa  167  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.81 
 
 		 695 aa  164  7e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  34.01 
 
 		 679 aa  164  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.72 
 
 		 685 aa  161  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  29.06 
 
 		 727 aa  159  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  29.62 
 
 		 684 aa  155  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  42.23 
 
 		 742 aa  144  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  44.69 
 
 		 710 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.47 
 
 		 728 aa  134  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  37.64 
 
 		 706 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  37.64 
 
 		 706 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  32.45 
 
 		 785 aa  114  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  32.85 
 
 		 787 aa  108  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  31 
 
 		 689 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  31 
 
 		 689 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  31 
 
 		 689 aa  107  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  31 
 
 		 689 aa  107  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  31 
 
 		 689 aa  107  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  33.65 
 
 		 689 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  30.25 
 
 		 691 aa  107  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  33.33 
 
 		 691 aa  106  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  34.52 
 
 		 755 aa  105  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  29.02 
 
 		 689 aa  105  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  33.96 
 
 		 691 aa  105  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.38 
 
 		 861 aa  103  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  30 
 
 		 702 aa  103  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.21 
 
 		 763 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.21 
 
 		 763 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  39.11 
 
 		 702 aa  102  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.88 
 
 		 716 aa  100  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  33.66 
 
 		 778 aa  100  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  32.52 
 
 		 762 aa  99.4  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  33 
 
 		 780 aa  99  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  35.62 
 
 		 712 aa  99.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  31.65 
 
 		 777 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>