More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4264 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4264  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 306 aa  593  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1171  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0382  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5671  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.840206  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7083  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.074768 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6420  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.83075  normal  0.614202 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5408  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133517  normal  0.0100846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4934  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2573  LysR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6995  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0324975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0303  putative transcriptional regulator  34.33 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02660  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0441  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1666  transcriptional regulator, LysR family  36.04 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2574  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2962  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478402  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3143  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3293  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6041  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756462  hitchhiker  0.00133745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3374  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 308 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0798334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3225  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.996696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.62 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3467  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2639  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2369  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2609  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2653  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0144  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1043  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.805531  normal  0.622996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2186  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4286  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.255291  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3722  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0682  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.670623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3422  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2385  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2787  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3023  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3404  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3454  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 418 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4576  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 306 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2937  transcriptional regulator, LysR family  30.33 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3466  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5863  Transcriptional regulator  30.49 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3648  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0594  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0004  LysR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2434  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2117  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.052237  normal  0.387945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06400  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2773  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2919  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2863  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.97885  normal  0.374459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2723  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.18 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.63808  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2418  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 312 aa  99  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3310  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.637496  normal  0.0770151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  33.61 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6279  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.853618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0131  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 307 aa  95.5  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3703  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6877  LysR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00333215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2950  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.954303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0370  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.825103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0362  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0275  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2053  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.79519  normal  0.0937075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  32.91 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3260  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.444883 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0367  transcriptional regulator  29.15 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1878  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1724  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0891  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1177  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2155  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2679  LysR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2004  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  32.31 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5839  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 311 aa  89  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 305 aa  89  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3097  transcriptional regulator, LysR family  26.44 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1568  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  27.46 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  34.82 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5882  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0613  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723423  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1242  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2993  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1111  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1591  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0175342  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6151  transcriptional regulator, LysR family  32.42 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>