More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3763 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  100 
 
 		 248 aa  491  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  80.49 
 
 		 262 aa  388  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  76.92 
 
 		 252 aa  374  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  75.3 
 
 		 254 aa  372  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7553  ribonuclease PH  77.5 
 
 		 243 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1326  ribonuclease PH  81.78 
 
 		 257 aa  363  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.777119  hitchhiker  0.000286825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  76.47 
 
 		 252 aa  362  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1323  ribonuclease PH  78.93 
 
 		 242 aa  360  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  75.63 
 
 		 252 aa  358  6e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  73.64 
 
 		 239 aa  355  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2734  ribonuclease PH  79.55 
 
 		 279 aa  354  8.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0760609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  72.69 
 
 		 239 aa  347  9e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3865  ribonuclease PH  76.67 
 
 		 239 aa  346  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  73.33 
 
 		 247 aa  344  6e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  74.37 
 
 		 240 aa  344  6e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  76.57 
 
 		 238 aa  341  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1364  ribonuclease PH  77.46 
 
 		 250 aa  328  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1031  ribonuclease PH  68.07 
 
 		 258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  70.94 
 
 		 288 aa  322  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1020  ribonuclease PH  69.04 
 
 		 254 aa  316  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0339  tRNA nucleotidyltransferase  67.4 
 
 		 253 aa  315  4e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5650  ribonuclease PH  72.22 
 
 		 260 aa  310  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  66.39 
 
 		 251 aa  308  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1546  ribonuclease PH  68.91 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.760762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1104  ribonuclease PH  68.83 
 
 		 241 aa  308  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  65.4 
 
 		 260 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0994  ribonuclease PH  68.42 
 
 		 241 aa  305  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  62.61 
 
 		 237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0870  ribonuclease PH  70.59 
 
 		 247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  63.52 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  63.27 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1701  ribonuclease PH  68.49 
 
 		 246 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.17915  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 237 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11370  ribonuclease PH  63.87 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.358864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  62.18 
 
 		 237 aa  299  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  65.13 
 
 		 260 aa  298  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  61.09 
 
 		 238 aa  297  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  61.6 
 
 		 237 aa  297  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  61.6 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  61.6 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  61.6 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  61.6 
 
 		 237 aa  295  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29110  ribonuclease PH  68.91 
 
 		 258 aa  295  6e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.900543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  60.5 
 
 		 237 aa  295  6e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  63.29 
 
 		 241 aa  295  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 237 aa  294  8e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  62.4 
 
 		 246 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  64.29 
 
 		 253 aa  294  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  62.4 
 
 		 246 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  60.76 
 
 		 237 aa  293  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  62.4 
 
 		 246 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  62.5 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4568  ribonuclease PH  63.03 
 
 		 237 aa  292  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000188043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2358  ribonuclease PH  64.98 
 
 		 260 aa  291  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0822921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  62.5 
 
 		 243 aa  291  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  62.08 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  63.71 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  61.34 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  61.16 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  61.67 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  61.57 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  61.16 
 
 		 246 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 235 aa  289  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 235 aa  289  3e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  60.92 
 
 		 239 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  60.92 
 
 		 239 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  61.16 
 
 		 246 aa  287  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  62.82 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0378  ribonuclease PH  61.76 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3836  ribonuclease PH  61.76 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  60.76 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  60.76 
 
 		 238 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 247 aa  285  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  62.61 
 
 		 238 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  61.6 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  60.5 
 
 		 238 aa  285  4e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  61.6 
 
 		 238 aa  285  5e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0369  ribonuclease PH  64.15 
 
 		 237 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0395  ribonuclease PH  64.15 
 
 		 237 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000781282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0370  ribonuclease PH  64.15 
 
 		 237 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0381  ribonuclease PH  64.15 
 
 		 237 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  63.87 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  60.57 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  63.87 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  63.87 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  63.87 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  63.45 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  63.45 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  63.45 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  58.94 
 
 		 246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  61.6 
 
 		 238 aa  281  6.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>