More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3682 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3682  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
368 aa  694    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558213  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 
355 aa  93.2  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.42 
 
 
378 aa  89.7  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.72 
 
 
459 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.72 
 
 
462 aa  89  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
355 aa  86.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.66 
 
 
370 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4585  glycosyl transferase group 1  39.58 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
748 aa  83.2  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  32.32 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  34.1 
 
 
384 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  36.47 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  35.26 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3472  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  35.33 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
377 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
421 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3384  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  40.21 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  40.21 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  26.98 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  29.26 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6051  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.96 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  36.14 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  25.49 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.41 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.22 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  32.89 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0483  glycosyl transferase, group 1  41.5 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0979566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  38.71 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  34.48 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  28.43 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4095  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166575  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  37.71 
 
 
439 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  29.55 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
426 aa  73.2  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
409 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  33.11 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  25 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
381 aa  72  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1488  glycosyl transferase group 1  39.85 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0380983  normal  0.669661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3530  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000188303  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  32.76 
 
 
426 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  33.13 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
810 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0054  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  29.87 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  38.36 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  37.34 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  36.88 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
822 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  36.55 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  34.8 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>