More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2094 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2094  ABC transporter related  100 
 
 		 367 aa  723    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2598  ABC transporter related  68.58 
 
 		 375 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375786  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2559  ABC transporter related  67.21 
 
 		 375 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2604  ABC transporter related  67.21 
 
 		 375 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4070  ABC transporter related protein  56.42 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2492  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 370 aa  295  6e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.469403  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  43.95 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  44.25 
 
 		 355 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03330  ABC transporter related  42.86 
 
 		 378 aa  276  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  43.18 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  42.27 
 
 		 372 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.98 
 
 		 373 aa  269  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2451  ABC transporter related  45.17 
 
 		 364 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.98 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.02 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  42.94 
 
 		 349 aa  266  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  41.06 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  42.82 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  41.06 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  44.69 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.28 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1416  ABC transporter related  44.29 
 
 		 347 aa  263  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10901  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.44 
 
 		 351 aa  262  4.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.44 
 
 		 351 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  41.73 
 
 		 365 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1655  ABC transporter related  43.9 
 
 		 361 aa  262  8e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  44.04 
 
 		 371 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2849  ABC transporter-related protein  43.73 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.72 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0947  ATPase  43.45 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  45.03 
 
 		 372 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03320  ABC transporter related  38.92 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  41.96 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  40.93 
 
 		 391 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  44.04 
 
 		 371 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.72 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  41.06 
 
 		 360 aa  259  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  43.27 
 
 		 371 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4487  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 		 369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0603  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  41.16 
 
 		 365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4422  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 		 369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4572  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 		 369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4573  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 		 369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.01143 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4624  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 		 369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  44.85 
 
 		 353 aa  259  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.27 
 
 		 369 aa  258  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.39 
 
 		 372 aa  258  8e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0240  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.35 
 
 		 369 aa  258  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4289  ABC transporter related  41.81 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  39.62 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  39.56 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  43.01 
 
 		 371 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  41.94 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  41.69 
 
 		 360 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  40.72 
 
 		 362 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  40.55 
 
 		 369 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  39.57 
 
 		 369 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  42.26 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  44.09 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  43.21 
 
 		 371 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  38.92 
 
 		 369 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 361 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  41.86 
 
 		 351 aa  256  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03907  fused maltose transport subunit, ATP-binding component of ABC superfamily/regulatory protein  42.4 
 
 		 371 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3960  ABC transporter related protein  42.4 
 
 		 371 aa  256  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3994  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 371 aa  256  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153747  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5516  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 371 aa  256  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  38.54 
 
 		 358 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4587  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 371 aa  256  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4275  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 371 aa  256  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.16 
 
 		 351 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4497  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 371 aa  256  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03867  hypothetical protein  42.4 
 
 		 371 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.51 
 
 		 361 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  40.44 
 
 		 362 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4736  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.29 
 
 		 365 aa  255  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  42.34 
 
 		 357 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  40.87 
 
 		 360 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  43.53 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  41.88 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  41.11 
 
 		 402 aa  254  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.6 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.35 
 
 		 381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.95 
 
 		 356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  44.71 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0535  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.87 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3495  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.93 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0566  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.87 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  41.94 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.27 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.02 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  40.55 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.66 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0622  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.58 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  38.01 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  44.67 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0477  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.58 
 
 		 376 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  40.72 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  39.78 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>