60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2068 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  350  5.9999999999999994e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  39.11 
 
 		 194 aa  91.3  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  38.54 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.91 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.2 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  37.97 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  40.88 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  37.79 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.66 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  34.1 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1689  hypothetical protein  36.65 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0654906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  42.25 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  37.71 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  35.03 
 
 		 591 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  36.73 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  35.09 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  31.98 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  39.55 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  34.39 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  31.11 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  34.69 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.82 
 
 		 538 aa  52  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  26.01 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  30.64 
 
 		 370 aa  51.6  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  31.55 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.17 
 
 		 533 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  31.19 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.64 
 
 		 534 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  33.1 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  30.77 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  32 
 
 		 203 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.82 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 372 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1827  hypothetical protein  40.15 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  41.23 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  29.78 
 
 		 534 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  38.3 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  38.3 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  31.82 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  31.82 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.06 
 
 		 538 aa  45.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10350  hypothetical protein  33.08 
 
 		 136 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  33.59 
 
 		 188 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  27.17 
 
 		 205 aa  44.7  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.21 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  34.65 
 
 		 455 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  31.46 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  28.79 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  32.82 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  27.27 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.26 
 
 		 428 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  36.84 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.66 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.49 
 
 		 533 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.84 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  32.89 
 
 		 234 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2270  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  29.75 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  25.69 
 
 		 187 aa  41.2  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  31.21 
 
 		 193 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.49 
 
 		 534 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>