More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1417 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1693  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  65.74 
 
 		 826 aa  1040    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0385634  normal  0.564105 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0699  DNA gyrase/topoisomerase IV, A subunit  51.2 
 
 		 887 aa  834    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1681  DNA topoisomerase IV subunit A  52.65 
 
 		 827 aa  761    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.638406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2131  DNA topoisomerase IV subunit A  60.94 
 
 		 831 aa  977    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1621  DNA topoisomerase IV subunit A  61.38 
 
 		 836 aa  1012    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000739384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1618  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  61.61 
 
 		 833 aa  961    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485256  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0303  DNA topoisomerase IV subunit A  53.26 
 
 		 909 aa  903    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.821853  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2387  DNA topoisomerase  63.07 
 
 		 841 aa  973    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0699814  normal  0.399735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1934  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  63.29 
 
 		 855 aa  1001    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.621213  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16040  DNA topoisomerase IV subunit A  65.81 
 
 		 824 aa  1083    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13190  DNA topoisomerase IV subunit A  57.91 
 
 		 868 aa  909    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1772  DNA topoisomerase IV subunit A  55.57 
 
 		 820 aa  906    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1546  DNA topoisomerase IV subunit A  57.38 
 
 		 826 aa  904    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0628876  normal  0.0572906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15900  DNA topoisomerase IV subunit A  62.32 
 
 		 823 aa  980    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0201184  normal  0.219646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7080  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  60.39 
 
 		 831 aa  955    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1675  DNA topoisomerase IV subunit A  53.02 
 
 		 827 aa  758    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.898685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2281  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.72 
 
 		 1143 aa  716    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  58.41 
 
 		 828 aa  932    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14430  DNA topoisomerase IV subunit A  60.65 
 
 		 822 aa  965    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0776832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1627  DNA topoisomerase IV subunit A  60.8 
 
 		 832 aa  991    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1435  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1422  DNA topoisomerase IV subunit A  59.51 
 
 		 813 aa  903    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 828 aa  1644    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.121142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2949  DNA topoisomerase IV subunit A  58.1 
 
 		 826 aa  907    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0430579  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1928  DNA topoisomerase IV subunit A  64.58 
 
 		 819 aa  997    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.769322  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08230  DNA topoisomerase IV subunit A  55.31 
 
 		 827 aa  829    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  42.18 
 
 		 841 aa  564  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  41 
 
 		 834 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  42.5 
 
 		 848 aa  554  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  43.01 
 
 		 812 aa  554  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  39.48 
 
 		 870 aa  553  1e-156  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  41.9 
 
 		 823 aa  551  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0007  DNA gyrase, A subunit  41.92 
 
 		 870 aa  551  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0197472 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  39.66 
 
 		 839 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  39.61 
 
 		 839 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  41.55 
 
 		 823 aa  547  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  40.11 
 
 		 893 aa  544  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  41.22 
 
 		 802 aa  545  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  41.52 
 
 		 834 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  40 
 
 		 875 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  41.08 
 
 		 820 aa  545  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  41.96 
 
 		 824 aa  541  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  40.05 
 
 		 932 aa  541  9.999999999999999e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0007  DNA gyrase subunit A  41.65 
 
 		 837 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.822047 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0007  DNA gyrase subunit A  40.7 
 
 		 836 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0674911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  37.97 
 
 		 853 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  41.24 
 
 		 838 aa  535  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0007  DNA gyrase A subunit  40.13 
 
 		 831 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  38.88 
 
 		 807 aa  534  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  40.72 
 
 		 839 aa  534  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00070  DNA gyrase subunit A  41.03 
 
 		 875 aa  534  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  40.85 
 
 		 839 aa  535  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116309 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1431  DNA gyrase subunit A  38.79 
 
 		 883 aa  533  1e-150  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  39.12 
 
 		 818 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  41.56 
 
 		 901 aa  535  1e-150  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  38.29 
 
 		 834 aa  530  1e-149  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0007  DNA gyrase subunit A  40.83 
 
 		 875 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876673  normal  0.542792 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  39.61 
 
 		 828 aa  529  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  39.84 
 
 		 809 aa  530  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0040  DNA gyrase, A subunit  39.45 
 
 		 876 aa  531  1e-149  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0008  DNA gyrase subunit A  41.54 
 
 		 831 aa  531  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0011  DNA gyrase, A subunit  41.21 
 
 		 822 aa  529  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81481  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0006  DNA gyrase, A subunit  43.4 
 
 		 816 aa  528  1e-148  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400994  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10006  DNA gyrase subunit A  40.08 
 
 		 838 aa  527  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  40.15 
 
 		 816 aa  527  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  39.5 
 
 		 848 aa  527  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  39.17 
 
 		 827 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  40.19 
 
 		 825 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  40.24 
 
 		 818 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  38.14 
 
 		 899 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0006  DNA gyrase, A subunit  40.46 
 
 		 827 aa  524  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0007  DNA gyrase subunit A  39.46 
 
 		 840 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277019  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  39.53 
 
 		 889 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  40.37 
 
 		 809 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  39.53 
 
 		 889 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0007  DNA gyrase, A subunit  40.5 
 
 		 839 aa  525  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  40.36 
 
 		 852 aa  523  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  39.35 
 
 		 828 aa  525  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0006  DNA gyrase subunit A  40.36 
 
 		 834 aa  523  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  39.05 
 
 		 809 aa  525  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  39.05 
 
 		 809 aa  521  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0010  DNA gyrase, A subunit  39.21 
 
 		 837 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  36.83 
 
 		 838 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  38.53 
 
 		 828 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  40.39 
 
 		 806 aa  520  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  37.94 
 
 		 812 aa  521  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  40.18 
 
 		 796 aa  520  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0008  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  39 
 
 		 836 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  37.78 
 
 		 807 aa  516  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0096  DNA gyrase, A subunit  39.09 
 
 		 827 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  38.81 
 
 		 811 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0006  DNA gyrase, A subunit  41.72 
 
 		 883 aa  518  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  39.68 
 
 		 856 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  38.79 
 
 		 809 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11138  DNA gyrase A subunit  39.33 
 
 		 848 aa  518  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185535  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  37.47 
 
 		 848 aa  513  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  38.58 
 
 		 823 aa  514  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  38.58 
 
 		 823 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  38.58 
 
 		 823 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  38.58 
 
 		 823 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  38.57 
 
 		 823 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>