More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0537 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
574 aa  1147    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  62.43 
 
 
572 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  58.69 
 
 
577 aa  633  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  62.25 
 
 
572 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.47 
 
 
550 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.75 
 
 
572 aa  618  1e-176  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 
616 aa  340  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  40.43 
 
 
616 aa  335  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  40.43 
 
 
616 aa  335  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
607 aa  316  9e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
611 aa  309  8e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
615 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
601 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
605 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  46.98 
 
 
589 aa  303  6.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  46.46 
 
 
601 aa  300  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
602 aa  300  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  37.98 
 
 
590 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 
596 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  37.35 
 
 
596 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.93 
 
 
605 aa  293  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
627 aa  293  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  39.02 
 
 
605 aa  293  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
599 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.47 
 
 
578 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 
566 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
589 aa  290  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
597 aa  290  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
563 aa  290  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
611 aa  276  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
564 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  33.04 
 
 
607 aa  263  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
540 aa  248  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
559 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 
549 aa  237  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 
592 aa  231  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
529 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
501 aa  201  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
525 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
463 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  28.23 
 
 
471 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  28.53 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
489 aa  130  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
608 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
609 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2451  histidine kinase  25.22 
 
 
722 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0542472  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 
722 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 
722 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152137  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
471 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
613 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 
722 aa  127  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856072  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1260  Signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 
483 aa  126  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000444987  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
640 aa  126  9e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
581 aa  126  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  27.86 
 
 
464 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
425 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
467 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  28.21 
 
 
466 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  34.65 
 
 
581 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  32.31 
 
 
571 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.74 
 
 
455 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2203  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 
719 aa  125  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  29.08 
 
 
463 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  27.19 
 
 
491 aa  124  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
621 aa  123  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
473 aa  123  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4936  sensory box histidine kinase  26.11 
 
 
617 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  31.88 
 
 
571 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2280  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 
719 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.372267  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2413  ATPase domain-containing protein  24.34 
 
 
719 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0954524  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  30.83 
 
 
477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  27.89 
 
 
496 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1753  histidine kinase  28.13 
 
 
578 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
597 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
458 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.33 
 
 
457 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  25 
 
 
469 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  26.78 
 
 
456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 
639 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  29.14 
 
 
458 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  29.14 
 
 
458 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  29.14 
 
 
458 aa  120  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  28.78 
 
 
458 aa  120  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
639 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  27.17 
 
 
453 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  28.78 
 
 
458 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  27.17 
 
 
453 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  28.48 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  27.17 
 
 
453 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  28.78 
 
 
458 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  27.17 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 
639 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  35.45 
 
 
581 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4968  sensory box histidine kinase  26.04 
 
 
609 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2192  sensor histidine kinase  23.95 
 
 
687 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
597 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 
641 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>