More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3444 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3444  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
132 aa  255  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3443  transcriptional regulator, ArsR family  80.77 
 
 
133 aa  206  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0667  putative transcriptional regulator, ArsR family  72.27 
 
 
128 aa  167  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3344  transcriptional regulator, MarR family  54.4 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1812  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 
141 aa  123  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122614  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1245  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.331226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 
109 aa  57.8  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
121 aa  57.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3096  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465743  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  35.48 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  43.66 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  43.66 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
317 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 
97 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  44.29 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  29.21 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
110 aa  53.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
258 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4077  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  45.76 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  28.89 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
106 aa  52.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
125 aa  52.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  41.1 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  43.28 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
110 aa  52  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  28.75 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  36.62 
 
 
94 aa  52  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  36.62 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0727  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  32.86 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  34.09 
 
 
128 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  35 
 
 
183 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  40 
 
 
112 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
112 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2405  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
110 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.673414  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
103 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
123 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  41.89 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  35.53 
 
 
113 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  35.53 
 
 
113 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
122 aa  50.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 
337 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  32 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.33 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.33 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.33 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  37.33 
 
 
117 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 
117 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.33 
 
 
117 aa  50.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  37.33 
 
 
117 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
125 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.33 
 
 
117 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
118 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>