More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3032 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
126 aa  245  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  81.75 
 
 
126 aa  206  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  75.2 
 
 
125 aa  183  6e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  75.4 
 
 
126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  70.16 
 
 
126 aa  179  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  65.08 
 
 
126 aa  171  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  66.13 
 
 
125 aa  166  9e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  69.67 
 
 
125 aa  165  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  65.18 
 
 
125 aa  152  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 
124 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 
124 aa  135  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 
124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  51.24 
 
 
124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  51.24 
 
 
124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 
124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 
124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 
124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  51.24 
 
 
127 aa  134  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
124 aa  134  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 
124 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 
124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 
129 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 
124 aa  129  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 
128 aa  128  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 
123 aa  128  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 
125 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 
127 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
143 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 
127 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  49.59 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  46.77 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  52.38 
 
 
135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 
127 aa  124  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
140 aa  124  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 
125 aa  124  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
129 aa  122  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
126 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 
128 aa  122  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
125 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
124 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
126 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 
127 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 
126 aa  121  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 
126 aa  121  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 
133 aa  120  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 
127 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 
124 aa  120  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  50.4 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 
124 aa  118  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  47.2 
 
 
128 aa  117  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
126 aa  117  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
126 aa  117  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
126 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 
125 aa  116  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
125 aa  116  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
132 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  48 
 
 
126 aa  115  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  45.53 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  51.22 
 
 
129 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 
131 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 
131 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
127 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
126 aa  114  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 
141 aa  114  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  43.75 
 
 
130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  47.58 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  44.88 
 
 
127 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 
129 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  43.75 
 
 
129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  44.8 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>