85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2310 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  76.06 
 
 		 447 aa  710    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  87.64 
 
 		 445 aa  824    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  100 
 
 		 445 aa  916    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  74.38 
 
 		 444 aa  687    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1739  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  76.91 
 
 		 447 aa  709    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0828  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  34.89 
 
 		 464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0208074 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  34.62 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0678  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0215835  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  31.43 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  36.65 
 
 		 369 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0676  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.57 
 
 		 385 aa  157  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000283469  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  31.77 
 
 		 390 aa  154  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.71 
 
 		 383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  31.82 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0621  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase (HMG-CoA synthase)  32.52 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000102903  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04923  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, expressed (Eurofung)  29.43 
 
 		 459 aa  149  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000140052  normal  0.183137 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.7 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2613  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  28.97 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1470  putative polyketide biosynthesis protein pksG  28.97 
 
 		 419 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0349844  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1384  putative polyketide biosynthesis protein pksG  28.97 
 
 		 419 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.25 
 
 		 437 aa  143  5e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  32.51 
 
 		 389 aa  143  6e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1212  polyketide biosynthesis protein, interruption-N  28.9 
 
 		 389 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.737994  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.69 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2884  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  28.88 
 
 		 419 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5295  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.58 
 
 		 417 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0778158  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.3 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.3 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1179  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  27.02 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_83020  predicted protein  28.89 
 
 		 447 aa  130  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2601  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  30.25 
 
 		 424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.914531 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.05 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1670  polyketide biosynthesis protein  27.49 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.130518  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1931  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase family protein  26.73 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.808673  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02670  conserved hypothetical protein  26.72 
 
 		 492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  27.18 
 
 		 412 aa  113  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  27.18 
 
 		 412 aa  113  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05080  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, putative  27.31 
 
 		 498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0146937  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16649  predicted protein  28.27 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24052  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0703  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.98 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2595  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.51 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1418  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.67 
 
 		 420 aa  104  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  26.7 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  23.68 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  29.96 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  24.74 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  30.84 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  29.11 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  24.8 
 
 		 349 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  25.99 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  23.71 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  27.47 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  24.19 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  29.03 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  24.18 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  25.15 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  27.45 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  34.81 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  29.96 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  27.97 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  23.88 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  24.93 
 
 		 348 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  26.92 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  27.16 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  24.93 
 
 		 348 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.41 
 
 		 350 aa  52.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1684  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  32.88 
 
 		 316 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000249118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3501  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  32.88 
 
 		 316 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246754  decreased coverage  0.00135682 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  27 
 
 		 351 aa  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1576  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  32.88 
 
 		 316 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.70406e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1993  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  34.21 
 
 		 317 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302649  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2176  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  34.21 
 
 		 317 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00253287  hitchhiker  0.000000000000149939 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1263  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  34.21 
 
 		 317 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00141014  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1307  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  34.21 
 
 		 317 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0184872  hitchhiker  0.000000000000113023 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1292  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  34.21 
 
 		 317 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000523087  hitchhiker  2.7964e-16 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01087  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  33.33 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000578388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2556  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  33.33 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000231699  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1213  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  33.33 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.16382e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01095  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000485703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1470  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  33.33 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000946289  hitchhiker  0.00000000000127697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2233  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  33.33 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000918964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2036  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  33.33 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000955089  decreased coverage  0.000000634537 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2510  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  33.33 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000101658  hitchhiker  0.0000844737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1212  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  33.33 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>