66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2710 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  396  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  44.71 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  44.71 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  43.79 
 
 		 190 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  44.12 
 
 		 190 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  33.68 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  34.59 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  32.49 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  37.11 
 
 		 172 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  32.14 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  35.62 
 
 		 201 aa  98.2  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  35.29 
 
 		 209 aa  96.3  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  33.73 
 
 		 175 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  34.68 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  37.95 
 
 		 175 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  35.4 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  36.09 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  35.37 
 
 		 195 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  35.5 
 
 		 193 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  34.71 
 
 		 175 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  36.71 
 
 		 175 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  36.02 
 
 		 175 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  35.67 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  32.6 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  32.3 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  33.77 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  36.52 
 
 		 477 aa  75.5  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  29.01 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  31.34 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  31.88 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  25.65 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  26.85 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  28.05 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  29.79 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  30.51 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  31.36 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  33.9 
 
 		 394 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  33.05 
 
 		 394 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  33.05 
 
 		 394 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  30.51 
 
 		 395 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  32.2 
 
 		 394 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  29.66 
 
 		 393 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  27.08 
 
 		 231 aa  53.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  30.39 
 
 		 156 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  28.95 
 
 		 702 aa  52.4  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  28.95 
 
 		 702 aa  52.4  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  28.89 
 
 		 177 aa  51.6  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  27.66 
 
 		 151 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  30.61 
 
 		 388 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  30.61 
 
 		 388 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  33.07 
 
 		 166 aa  48.5  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  29.41 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  35 
 
 		 100 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  32.32 
 
 		 546 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  45.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  29.47 
 
 		 220 aa  44.7  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  30 
 
 		 101 aa  45.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  34.91 
 
 		 664 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5620  cytochrome c, mono-and diheme variant-like protein  28.97 
 
 		 398 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  27.59 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  32.61 
 
 		 254 aa  42  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  26.83 
 
 		 513 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  26.83 
 
 		 513 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  31.58 
 
 		 174 aa  41.6  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  30.34 
 
 		 320 aa  41.2  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  36.78 
 
 		 647 aa  41.2  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>