More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0552 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  44.59 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  43.4 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0440  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  43.91 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  43.04 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  47.56 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 		 231 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 235 aa  180  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  42.98 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  42.98 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  42.98 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  42.98 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  42.98 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  42.98 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  42.98 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  42.98 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  42.55 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  42.98 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  44.05 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  42.92 
 
 		 224 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  42.13 
 
 		 248 aa  178  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 224 aa  178  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 231 aa  178  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  42.55 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 261 aa  175  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 227 aa  175  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 234 aa  175  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  41.7 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 235 aa  175  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 226 aa  174  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 228 aa  174  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  44.02 
 
 		 290 aa  174  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 229 aa  174  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1539  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000287281  normal  0.103291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4054  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  41.78 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  43.75 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.04 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  41.67 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  41.85 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  41.96 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  43.04 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 237 aa  171  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 321 aa  170  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  41.74 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 239 aa  169  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 231 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>