222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0331 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  100 
 
 
198 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  36.32 
 
 
200 aa  118  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  36.84 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  35.53 
 
 
197 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  35.98 
 
 
190 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  34.02 
 
 
192 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  34.2 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  31.31 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  38.17 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  33.51 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  33.51 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  33.85 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  34.57 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  38.71 
 
 
173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  33.51 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  33.51 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  33.51 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  33.51 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  33.51 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  32.49 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  34.54 
 
 
208 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  32.83 
 
 
187 aa  112  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  34.18 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  34.24 
 
 
191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  34.08 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  34.18 
 
 
192 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  34.18 
 
 
192 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  34.18 
 
 
192 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  33.67 
 
 
192 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  33.67 
 
 
192 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  34.69 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  34.05 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0457  hypothetical protein  38.74 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  31.44 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  34.02 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  32.26 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  34.54 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  34.02 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  31.96 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  34.05 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  34.59 
 
 
193 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  36.26 
 
 
192 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  34.08 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  34.43 
 
 
199 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  33.89 
 
 
199 aa  108  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  36.26 
 
 
187 aa  108  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  33.89 
 
 
199 aa  108  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  35.05 
 
 
190 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  34.24 
 
 
188 aa  107  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  34.44 
 
 
195 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  32.61 
 
 
184 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  31.35 
 
 
216 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  34.18 
 
 
189 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  31.22 
 
 
197 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4073  protein of unknown function DUF179  35.86 
 
 
197 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.424244  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  33.85 
 
 
213 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  33.51 
 
 
187 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  34.01 
 
 
185 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  34.44 
 
 
203 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  34.54 
 
 
190 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  34.01 
 
 
187 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  33.16 
 
 
191 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  34.01 
 
 
187 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4106  protein of unknown function DUF179  35.86 
 
 
197 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  32.8 
 
 
186 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  104  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  34.97 
 
 
189 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  32.47 
 
 
191 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  29.41 
 
 
174 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  33.5 
 
 
214 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  33.15 
 
 
188 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  36.22 
 
 
216 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 
189 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  32.97 
 
 
192 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  33.68 
 
 
189 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  33.85 
 
 
187 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  32.5 
 
 
185 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  32.99 
 
 
192 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  32.5 
 
 
185 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  34.03 
 
 
192 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  31.71 
 
 
186 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  31.84 
 
 
189 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  32.45 
 
 
186 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  35.64 
 
 
217 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  32.43 
 
 
185 aa  101  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  32.14 
 
 
206 aa  101  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  29.72 
 
 
234 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  31.58 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  33.68 
 
 
185 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  32.14 
 
 
210 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  30.41 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  31.58 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  33.67 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  33.85 
 
 
187 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  33.85 
 
 
187 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  33.67 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  34.66 
 
 
187 aa  99  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  29.9 
 
 
197 aa  98.6  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>