More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0402 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  51.17 
 
 		 629 aa  639    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  100 
 
 		 645 aa  1293    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  62.95 
 
 		 639 aa  790    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  59.06 
 
 		 678 aa  728    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  49.23 
 
 		 638 aa  620  1e-176  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  49.22 
 
 		 650 aa  608  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  49.3 
 
 		 644 aa  601  1e-170  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  49.53 
 
 		 648 aa  594  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  48.82 
 
 		 660 aa  581  1e-164  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  49.92 
 
 		 658 aa  575  1.0000000000000001e-162  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  44.22 
 
 		 651 aa  542  1e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  36.94 
 
 		 591 aa  394  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  37.48 
 
 		 601 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  36.04 
 
 		 601 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  35.97 
 
 		 602 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  35.89 
 
 		 601 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  33.91 
 
 		 590 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  38.56 
 
 		 620 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  33.97 
 
 		 590 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  34.07 
 
 		 596 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  35.22 
 
 		 718 aa  381  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  34.59 
 
 		 596 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  34.07 
 
 		 590 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  35.46 
 
 		 603 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  33.33 
 
 		 590 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  37 
 
 		 596 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  34.12 
 
 		 596 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  36.66 
 
 		 585 aa  372  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  33.8 
 
 		 596 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  35.97 
 
 		 601 aa  365  1e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  34.01 
 
 		 625 aa  361  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  34.89 
 
 		 595 aa  356  6.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.33 
 
 		 614 aa  355  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.19 
 
 		 702 aa  354  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.95 
 
 		 598 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.61 
 
 		 598 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.97 
 
 		 575 aa  352  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.08 
 
 		 588 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.28 
 
 		 598 aa  350  6e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.63 
 
 		 721 aa  347  3e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  35.61 
 
 		 619 aa  347  3e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.11 
 
 		 608 aa  347  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  35.67 
 
 		 589 aa  347  6e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.27 
 
 		 598 aa  346  8.999999999999999e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.34 
 
 		 598 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.54 
 
 		 601 aa  346  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.94 
 
 		 598 aa  345  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.99 
 
 		 598 aa  343  5e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  35.83 
 
 		 601 aa  342  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  33.81 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.81 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.81 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  36.83 
 
 		 586 aa  342  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  33.82 
 
 		 631 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  35.84 
 
 		 606 aa  340  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  33.23 
 
 		 622 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  37.84 
 
 		 620 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  37.06 
 
 		 649 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  36.18 
 
 		 661 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  33.61 
 
 		 598 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.66 
 
 		 582 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  35.14 
 
 		 617 aa  334  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.64 
 
 		 670 aa  334  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  33.61 
 
 		 605 aa  333  5e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  32.91 
 
 		 691 aa  332  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.17 
 
 		 597 aa  332  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.17 
 
 		 597 aa  332  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  38.38 
 
 		 468 aa  330  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  34.97 
 
 		 606 aa  330  4e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  33.65 
 
 		 620 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  34.85 
 
 		 666 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  35.08 
 
 		 663 aa  328  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  35.08 
 
 		 623 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.27 
 
 		 617 aa  327  5e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.07 
 
 		 677 aa  326  7e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  37.81 
 
 		 733 aa  326  9e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  37.93 
 
 		 598 aa  326  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  35.8 
 
 		 634 aa  324  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  35.96 
 
 		 672 aa  324  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.47 
 
 		 637 aa  323  5e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.03 
 
 		 608 aa  323  9.000000000000001e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.63 
 
 		 556 aa  322  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  31.73 
 
 		 613 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  35.77 
 
 		 652 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  34.29 
 
 		 609 aa  322  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.11 
 
 		 587 aa  321  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  30.62 
 
 		 636 aa  321  3e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  32.03 
 
 		 607 aa  320  3.9999999999999996e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  33.67 
 
 		 589 aa  319  9e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  38.12 
 
 		 575 aa  319  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  36.28 
 
 		 669 aa  319  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  31.27 
 
 		 579 aa  318  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.35 
 
 		 572 aa  318  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0738  ABC transporter related  33.6 
 
 		 614 aa  318  2e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  34.65 
 
 		 680 aa  318  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  32.15 
 
 		 566 aa  317  4e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 		 571 aa  317  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.84 
 
 		 571 aa  317  6e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  37.93 
 
 		 612 aa  317  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.84 
 
 		 571 aa  317  6e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>