241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1974 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1974  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  100 
 
 		 414 aa  838    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  68.69 
 
 		 447 aa  555  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  68.77 
 
 		 447 aa  550  1e-155  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2074  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  65.62 
 
 		 451 aa  519  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2507  RimK domain protein ATP-grasp  53.4 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.451743 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.49 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.41 
 
 		 296 aa  102  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  31.67 
 
 		 292 aa  97.1  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.44 
 
 		 324 aa  94  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  28.11 
 
 		 293 aa  92  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  37.31 
 
 		 314 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  27.3 
 
 		 299 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  30.43 
 
 		 329 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.82 
 
 		 314 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.49 
 
 		 299 aa  86.3  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  29.41 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  32.52 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.99 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  28.17 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.5 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2103  ribosomal protein S6 modification protein  32.35 
 
 		 301 aa  82.8  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.01 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.5 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2165  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.82 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  28.42 
 
 		 269 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.55 
 
 		 283 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  37.96 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21920  RimK-like protein  36 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0852539  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.1 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  31.79 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.8 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  27.64 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.2 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.52 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  30.29 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  28.95 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  26.37 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  27.33 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  30.2 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  41.05 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  39.56 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  37.38 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  39.56 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  26.47 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  26.47 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  26.53 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  32.64 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.13 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  27.21 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  26.63 
 
 		 292 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  33.83 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  39.8 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  30.46 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.14 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.5 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  41.12 
 
 		 305 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  27.05 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  29.19 
 
 		 299 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  30.46 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  28.87 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  30.21 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.21 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.86 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  31.5 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  30.21 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  30.21 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  30.21 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  30.21 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  28.19 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  28.71 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  30.21 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.28 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  35.64 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  29.15 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  38.71 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.17 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.17 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  38.71 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  38.71 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  30.21 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  38.71 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  36.46 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  35.64 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.92 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.76 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.9 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  27.37 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.95 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  36.67 
 
 		 301 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  29.95 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  36.73 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  30.73 
 
 		 300 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.19 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.2 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.47 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  27.59 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  31.19 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  29.35 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  31.19 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  35.59 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>