More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1804 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1804  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
267 aa  531  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  56.64 
 
 
258 aa  275  6e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0125  extracellular solute-binding protein family 3  52.69 
 
 
270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  38.05 
 
 
243 aa  156  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  37.23 
 
 
244 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 
264 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 
250 aa  138  7.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  36.32 
 
 
264 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 
247 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  34.44 
 
 
501 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  36.68 
 
 
281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  31.98 
 
 
247 aa  125  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.57 
 
 
513 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 
246 aa  123  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  34.7 
 
 
260 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24310  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  36.44 
 
 
264 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  30.25 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  32.96 
 
 
254 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  35.82 
 
 
260 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  34.9 
 
 
268 aa  119  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  35.44 
 
 
276 aa  119  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  35.45 
 
 
260 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  32.2 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  34.67 
 
 
252 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  33.78 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2962  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 
287 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  33.6 
 
 
257 aa  115  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  32.71 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  30.2 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  32.9 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  32.31 
 
 
273 aa  112  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  29.34 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.15 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  31.35 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.77 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  33.77 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.15 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  30.34 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  31.42 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.77 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.08 
 
 
248 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.92 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31 
 
 
248 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31 
 
 
248 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31 
 
 
248 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31 
 
 
248 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
266 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  31.67 
 
 
283 aa  110  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31 
 
 
248 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  31 
 
 
248 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31 
 
 
248 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31 
 
 
248 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2306  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000079937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  29.96 
 
 
266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.15 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1402  extracellular solute-binding protein family 3  35.96 
 
 
261 aa  108  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16775  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31 
 
 
248 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.95 
 
 
266 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31 
 
 
248 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31 
 
 
248 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31 
 
 
248 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31 
 
 
248 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 
264 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1044  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.33 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180668  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0962  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.33 
 
 
245 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0994  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.33 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1025  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.33 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0927  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.33 
 
 
245 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.53 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.53 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.53 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3227  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
261 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1379  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.33 
 
 
243 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  29.39 
 
 
243 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.39 
 
 
250 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.03 
 
 
243 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  31.44 
 
 
247 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.39 
 
 
250 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  29.82 
 
 
251 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.39 
 
 
250 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.44 
 
 
247 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 
257 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.39 
 
 
250 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0991  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.47 
 
 
243 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 
265 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1022  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.47 
 
 
243 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0959  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.47 
 
 
243 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.08 
 
 
244 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.72 
 
 
248 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2733  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.92 
 
 
243 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0727882  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>