More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1534 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.49 
 
 
688 aa  719    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0158  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.41 
 
 
684 aa  777    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1534  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
688 aa  1362    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.887236  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2672  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 
659 aa  485  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0528368  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1598  histidine kinase  41.72 
 
 
689 aa  465  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2437  sensor histidine kinase  39.22 
 
 
704 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166276  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 
693 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1998  Signal transduction histidine kinase  40 
 
 
694 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.689731  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 
694 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0703  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 
703 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
712 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0750  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
680 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3103  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
688 aa  365  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3296  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 
672 aa  360  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.593293  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03285  sensor histidine kinase  34.66 
 
 
675 aa  333  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5031  sensor histidine kinase  35.09 
 
 
677 aa  326  9e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.61 
 
 
711 aa  305  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0429  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
690 aa  289  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0815441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3440  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
708 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184047  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0949  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
706 aa  259  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.317535  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
697 aa  248  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.445047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 
690 aa  236  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1993  histidine kinase  28.96 
 
 
696 aa  228  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.124604  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2444  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
695 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2439  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
690 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1941  sensor histidine kinase  31.48 
 
 
677 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2325  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
681 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136199  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2196  histidine kinase  27.54 
 
 
684 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0661  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
686 aa  171  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3043  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 
678 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546021  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0849  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 
701 aa  148  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
581 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2407  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
662 aa  88.2  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670085  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
1527 aa  87.4  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2758  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 
857 aa  87.4  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  32.02 
 
 
581 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0352523 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.08 
 
 
546 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
525 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4355  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 
638 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4378  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 
627 aa  84  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.055155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2443  histidine kinase  30.92 
 
 
578 aa  84  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
525 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4222  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.4 
 
 
627 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288914  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
1275 aa  81.6  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 
983 aa  80.9  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  31.51 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
591 aa  80.9  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3433  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
503 aa  80.5  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0364545 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 
814 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  29.29 
 
 
1347 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
581 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0446  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
1527 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
594 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1602  histidine kinase  26.98 
 
 
400 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000727154  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 
614 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
526 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
553 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0515  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
689 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0565  histidine kinase  36.11 
 
 
237 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0568  histidine kinase  36.41 
 
 
237 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  26.69 
 
 
594 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2392  histidine kinase  38.52 
 
 
502 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 
689 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0334119  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
544 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0536  histidine kinase  35.44 
 
 
247 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.204687  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0709  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 
489 aa  77  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.737809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
1131 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3364  histidine kinase  30.7 
 
 
249 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 
1419 aa  77  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2976  histidine kinase  34.21 
 
 
233 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241356  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
1527 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1707  histidine kinase  33.87 
 
 
462 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
372 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 
931 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
462 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3521  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.94 
 
 
1022 aa  75.5  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.86 
 
 
688 aa  75.5  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 
837 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2383  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.65 
 
 
484 aa  75.5  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311727  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
661 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.73 
 
 
1016 aa  75.1  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  31.82 
 
 
524 aa  75.1  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  28.79 
 
 
600 aa  75.1  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
619 aa  75.1  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
461 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  30.64 
 
 
573 aa  74.7  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
575 aa  74.3  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.78 
 
 
981 aa  74.3  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
662 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
642 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
493 aa  74.3  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42670  Sensory histidine protein kinase CbrA  29.39 
 
 
981 aa  74.3  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416099  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1970  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
602 aa  74.3  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316288  normal  0.365319 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
776 aa  73.9  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
503 aa  73.9  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.534636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
642 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
646 aa  73.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 
905 aa  73.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>