94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4754 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4754  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  100 
 
 
383 aa  782    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0065  secreted hydrolase-like protein  49.47 
 
 
376 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0192  secreted hydrolase-like protein  49.47 
 
 
374 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400683  normal  0.94158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0002  secreted hydrolase-like protein  49.34 
 
 
387 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000706868  unclonable  0.000000000576659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2186  hypothetical protein  43.95 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2208  hypothetical protein  42.59 
 
 
375 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.543456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  46.31 
 
 
375 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  46.33 
 
 
387 aa  313  4.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1993  secreted hydrolase-like protein  46.63 
 
 
413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11006  hypothetical protein  42.9 
 
 
386 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.19907e-56  normal  0.122138 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1313  hypothetical protein  39.11 
 
 
381 aa  267  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.447479  normal  0.673608 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1686  Protein of unknown function DUF2006  41.81 
 
 
384 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1611  hypothetical protein  38.03 
 
 
379 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1006  hypothetical protein  40.29 
 
 
378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001048  hypothetical protein  39.38 
 
 
374 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1774  hypothetical protein  37.71 
 
 
370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341768  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04770  hydrolase  38.68 
 
 
369 aa  224  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2028  hypothetical protein  38.75 
 
 
355 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4108  hypothetical protein  32.96 
 
 
390 aa  216  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5298  hypothetical protein  37.65 
 
 
361 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1837  hypothetical protein  38.84 
 
 
398 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3745  hypothetical protein  38.42 
 
 
359 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114151  normal  0.0295635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4398  hypothetical protein  36.45 
 
 
362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117298  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0855  hypothetical protein  35.49 
 
 
425 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1922  hypothetical protein  38.26 
 
 
392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4688  hypothetical protein  36.45 
 
 
362 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3203  hypothetical protein  33.24 
 
 
412 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2041  hypothetical protein  36.99 
 
 
390 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.010776  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6286  hypothetical protein  35.29 
 
 
359 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1636  hypothetical protein  37.39 
 
 
353 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3423  hypothetical protein  33.51 
 
 
416 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0625  hypothetical protein  34.82 
 
 
368 aa  206  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0344  hypothetical protein  35.76 
 
 
362 aa  205  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0639153  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0711  hypothetical protein  33.24 
 
 
416 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0554  hypothetical protein  34.13 
 
 
395 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.817301  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6017  hypothetical protein  36.65 
 
 
356 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3311  hypothetical protein  33.78 
 
 
416 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3352  hypothetical protein  36.15 
 
 
354 aa  202  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0078  hypothetical protein  36.23 
 
 
346 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0255  hypothetical protein  36.13 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1279  hypothetical protein  36.13 
 
 
409 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000467326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5157  secreted hydrolase-like protein  35.71 
 
 
374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3955  hypothetical protein  35.37 
 
 
393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779914  normal  0.022032 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3146  hypothetical protein  35.15 
 
 
403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0866  hypothetical protein  35.31 
 
 
390 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3228  secreted hydrolase-like  36.69 
 
 
364 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3509  hypothetical protein  32.17 
 
 
394 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2030  secreted hydrolase-like protein  34.99 
 
 
351 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0893  putative AttH  36.62 
 
 
386 aa  193  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.27416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1194  hypothetical protein  36.5 
 
 
371 aa  192  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000162993  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3733  ABC transporter lipoprotein, putative  34.99 
 
 
352 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142601  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0831  hypothetical protein  32.35 
 
 
400 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1458  secreted hydrolase-like protein  36.28 
 
 
372 aa  192  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1540  secreted hydrolase  34.03 
 
 
364 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3480  secreted hydrolase-like protein  35.47 
 
 
358 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1176  hypothetical protein  35.11 
 
 
335 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00359132  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3020  secreted hydrolase-like protein  35.11 
 
 
364 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0547861  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0191  secreted hydrolase  33.75 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212117  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2048  hypothetical protein  35.05 
 
 
374 aa  189  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.356094  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1286  secreted hydrolase-like protein  35.16 
 
 
377 aa  189  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0653  hypothetical protein  35.01 
 
 
408 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0854  hypothetical protein  30.9 
 
 
404 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2555  putative lipoprotein  34.25 
 
 
352 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0803  hypothetical protein  35.01 
 
 
380 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2143  hypothetical protein  34.23 
 
 
387 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2642  putative lipoprotein  33.17 
 
 
384 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2668  hypothetical protein  34.37 
 
 
362 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00325621  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0684  hypothetical protein  33.13 
 
 
360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2462  secreted hydrolase-like protein  33.9 
 
 
380 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249104  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3116  secreted hydrolase-like protein  33.9 
 
 
380 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3629  putative AttH  34.47 
 
 
367 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00823607  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2173  putative lipoprotein  33.53 
 
 
351 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.296969  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1194  hypothetical protein  33.25 
 
 
360 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0311  hypothetical protein  32.61 
 
 
360 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2957  hypothetical protein  31.38 
 
 
400 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.338576 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1642  putative AttH  32.13 
 
 
389 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384305  normal  0.0577815 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003768  hypothetical protein  27.44 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02647  hydrolase  28.57 
 
 
374 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1519  putative AttH  32.34 
 
 
392 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5005  secreted hydrolase-like protein  32.74 
 
 
513 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  hitchhiker  0.00394498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01330  predicted secreted hydrolase  29.92 
 
 
450 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101344  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2025  membrane protein  28.75 
 
 
373 aa  145  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1580  putative secreted hydrolase  30.14 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125275  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  30.27 
 
 
663 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1234  hypothetical protein  25.23 
 
 
372 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000051189  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1176  hypothetical protein  28.48 
 
 
355 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000944356  normal  0.803843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1886  Protein of unknown function DUF2006  28.25 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0752233  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0983  prefoldin molecular chaperone  23.57 
 
 
550 aa  87.8  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.415206  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2690  secreted hydrolase-like protein  30.15 
 
 
442 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.444821  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4472  secreted hydrolase-like protein  28.57 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214249  normal  0.243711 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09234  conserved hypothetical protein  23.89 
 
 
347 aa  56.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5452  secreted hydrolase-like protein  28.28 
 
 
264 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0323  hypothetical protein  23.2 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2888  hypothetical protein  26.16 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.179405  normal  0.172957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>