21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0323 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0323  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  798    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4472  secreted hydrolase-like protein  25.83 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214249  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  27.23 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2208  hypothetical protein  25.22 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.543456  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0002  secreted hydrolase-like protein  21.99 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000706868  unclonable  0.000000000576659 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3480  secreted hydrolase-like protein  23.63 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2186  hypothetical protein  27.47 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0065  secreted hydrolase-like protein  22.88 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0311  hypothetical protein  23.61 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4398  hypothetical protein  24.14 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3228  secreted hydrolase-like  21.34 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1194  hypothetical protein  22.69 
 
 		 360 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  21.76 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4754  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  23.2 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772037  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2555  putative lipoprotein  24.83 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3745  hypothetical protein  23.21 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114151  normal  0.0295635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0344  hypothetical protein  24.91 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0639153  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5298  hypothetical protein  22.77 
 
 		 361 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6017  hypothetical protein  23.61 
 
 		 356 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1993  secreted hydrolase-like protein  22.6 
 
 		 413 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09234  conserved hypothetical protein  21.23 
 
 		 347 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>