47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5452 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5452  secreted hydrolase-like protein  100 
 
 		 264 aa  543  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1194  hypothetical protein  35.96 
 
 		 360 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1006  hypothetical protein  33.68 
 
 		 378 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2186  hypothetical protein  30.22 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1194  hypothetical protein  28.26 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000162993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4688  hypothetical protein  31.22 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11006  hypothetical protein  29.41 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.19907e-56  normal  0.122138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4398  hypothetical protein  30.39 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  25.39 
 
 		 663 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0002  secreted hydrolase-like protein  27.53 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000706868  unclonable  0.000000000576659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4754  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  28.28 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772037  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0344  hypothetical protein  29.47 
 
 		 362 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0639153  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1774  hypothetical protein  29.17 
 
 		 370 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341768  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1922  hypothetical protein  27.39 
 
 		 392 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5298  hypothetical protein  29.89 
 
 		 361 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2555  putative lipoprotein  30.43 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1458  secreted hydrolase-like protein  26.97 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6017  hypothetical protein  28.57 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0192  secreted hydrolase-like protein  26.46 
 
 		 374 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400683  normal  0.94158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3480  secreted hydrolase-like protein  27.07 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3733  ABC transporter lipoprotein, putative  28.49 
 
 		 352 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0065  secreted hydrolase-like protein  27.14 
 
 		 376 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3228  secreted hydrolase-like  25.64 
 
 		 364 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1313  hypothetical protein  27.46 
 
 		 381 aa  49.3  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.447479  normal  0.673608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1837  hypothetical protein  28.87 
 
 		 398 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0684  hypothetical protein  28.04 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1176  hypothetical protein  29.1 
 
 		 335 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00359132  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1993  secreted hydrolase-like protein  29.12 
 
 		 413 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3020  secreted hydrolase-like protein  29.51 
 
 		 364 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0547861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1279  hypothetical protein  27.36 
 
 		 409 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000467326 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2048  hypothetical protein  27.6 
 
 		 374 aa  46.6  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.356094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2030  secreted hydrolase-like protein  28.73 
 
 		 351 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  27.78 
 
 		 387 aa  46.2  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2462  secreted hydrolase-like protein  26.84 
 
 		 380 aa  46.2  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2028  hypothetical protein  28.72 
 
 		 355 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3352  hypothetical protein  28.57 
 
 		 354 aa  45.4  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  25.98 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0078  hypothetical protein  28.96 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1540  secreted hydrolase  27.96 
 
 		 364 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2173  putative lipoprotein  27.72 
 
 		 351 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.296969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0191  secreted hydrolase  26.94 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212117  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3116  secreted hydrolase-like protein  26.84 
 
 		 380 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3745  hypothetical protein  31.12 
 
 		 359 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114151  normal  0.0295635 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2041  hypothetical protein  27.84 
 
 		 390 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.010776  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2668  hypothetical protein  28.27 
 
 		 362 aa  43.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00325621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1636  hypothetical protein  31.12 
 
 		 353 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2208  hypothetical protein  27.22 
 
 		 375 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.543456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>